More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2957 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.92 
 
 
3470 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.42 
 
 
2107 aa  1162    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.85 
 
 
6889 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  45.7 
 
 
1789 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  45.21 
 
 
2847 aa  1238    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  46.53 
 
 
1143 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  45.39 
 
 
7279 aa  2115    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  46.59 
 
 
1601 aa  688    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.4 
 
 
2719 aa  958    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  43.16 
 
 
2066 aa  852    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  43.78 
 
 
2966 aa  1120    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.38 
 
 
3508 aa  1669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  52.56 
 
 
1548 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  47.1 
 
 
2367 aa  1062    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.98 
 
 
2333 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 
1832 aa  733    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.14 
 
 
1071 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  36.92 
 
 
1550 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  50.94 
 
 
3254 aa  1133    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  49.81 
 
 
1955 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 
3493 aa  1250    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  47.54 
 
 
1593 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  47.05 
 
 
6768 aa  1196    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.65 
 
 
2126 aa  995    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  34.73 
 
 
3235 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.82 
 
 
2762 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.86 
 
 
3670 aa  1412    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  39.41 
 
 
3308 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  36.99 
 
 
3498 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 
2551 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
1874 aa  993    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  37.86 
 
 
2033 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.4 
 
 
1656 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  36.59 
 
 
2581 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
3874 aa  1399    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 
1587 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.91 
 
 
3494 aa  1958    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.43 
 
 
2230 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 
3645 aa  1235    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 
5154 aa  1511    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  47.77 
 
 
4151 aa  1347    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  41.03 
 
 
4607 aa  861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 
4111 aa  1404    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  42.28 
 
 
1924 aa  1098    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.32 
 
 
1939 aa  855    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.29 
 
 
2024 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.95 
 
 
3148 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  44.63 
 
 
2060 aa  902    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47 
 
 
1602 aa  1041    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.15 
 
 
1087 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48.11 
 
 
2081 aa  867    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.45 
 
 
3111 aa  1163    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  38.43 
 
 
4930 aa  1555    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 
2880 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.46 
 
 
3693 aa  872    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.29 
 
 
1337 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.55 
 
 
2551 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.08 
 
 
1816 aa  1409    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.15 
 
 
1354 aa  693    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.32 
 
 
2462 aa  824    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.35 
 
 
4478 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  43.06 
 
 
1831 aa  1156    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  37.76 
 
 
2571 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 
3101 aa  1109    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.73 
 
 
1559 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.26 
 
 
1402 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.46 
 
 
3693 aa  872    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.6 
 
 
1349 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 
3676 aa  849    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  50.6 
 
 
2374 aa  867    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
3696 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.88 
 
 
4747 aa  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  44.49 
 
 
3355 aa  1118    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  42.68 
 
 
3400 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  44.09 
 
 
3408 aa  1393    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 
3702 aa  870    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 
3092 aa  1100    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.14 
 
 
3176 aa  813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.41 
 
 
2604 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 
3679 aa  851    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  35.96 
 
 
4968 aa  638    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  32.68 
 
 
1806 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 
2053 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  44.49 
 
 
7210 aa  2167    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  45.93 
 
 
3711 aa  2139    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  46.5 
 
 
1584 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  46.46 
 
 
3033 aa  979    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  45.12 
 
 
3463 aa  2059    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  50.39 
 
 
2376 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  35.09 
 
 
2439 aa  826    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  36.45 
 
 
4960 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
5400 aa  2247    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 
4840 aa  1696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.36 
 
 
2370 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 
7110 aa  2118    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.23 
 
 
8646 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 
5255 aa  1834    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  42.86 
 
 
3158 aa  1075    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  43.12 
 
 
4575 aa  1261    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  44.38 
 
 
2113 aa  1174    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>