More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2781 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.23 
 
 
5154 aa  2142    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.99 
 
 
3930 aa  1587    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
3463 aa  6710    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.62 
 
 
2090 aa  1173    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.45 
 
 
7210 aa  3072    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.45 
 
 
1602 aa  1108    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  65.61 
 
 
3033 aa  1497    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.49 
 
 
4840 aa  1717    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 
3645 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.13 
 
 
4882 aa  2100    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.11 
 
 
2719 aa  962    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.12 
 
 
2066 aa  1203    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.39 
 
 
1305 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  51.91 
 
 
1584 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  47.85 
 
 
3158 aa  1130    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.67 
 
 
3254 aa  1152    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  42.65 
 
 
4111 aa  1904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  50.87 
 
 
1593 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  50.69 
 
 
2367 aa  1117    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.51 
 
 
2551 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
1874 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.77 
 
 
1656 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.71 
 
 
1820 aa  1241    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 
1587 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.21 
 
 
3176 aa  764    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.59 
 
 
3508 aa  2298    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  44.68 
 
 
1402 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  47.9 
 
 
1924 aa  1222    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.8 
 
 
1816 aa  1749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.84 
 
 
2846 aa  1222    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.7 
 
 
1822 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.97 
 
 
5255 aa  2696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  50.87 
 
 
2376 aa  857    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  47.1 
 
 
2108 aa  1038    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 
1559 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  49.95 
 
 
2081 aa  832    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
3092 aa  1140    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.66 
 
 
1114 aa  748    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.52 
 
 
1349 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  48.03 
 
 
2113 aa  1242    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  39.38 
 
 
4264 aa  941    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  40.76 
 
 
3281 aa  1160    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.15 
 
 
3693 aa  904    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  49.19 
 
 
1831 aa  1369    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.8 
 
 
2847 aa  1246    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  49.1 
 
 
2107 aa  1237    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.11 
 
 
3494 aa  2727    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.34 
 
 
2966 aa  1254    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  40.95 
 
 
3449 aa  1318    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  54.26 
 
 
1101 aa  885    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.45 
 
 
1126 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.66 
 
 
1349 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.81 
 
 
1354 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.59 
 
 
6768 aa  1235    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  50 
 
 
1143 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.28 
 
 
1939 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.74 
 
 
4930 aa  2245    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  32.23 
 
 
1876 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.69 
 
 
1832 aa  735    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.45 
 
 
4478 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.01 
 
 
5400 aa  3133    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.84 
 
 
2126 aa  1066    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.15 
 
 
3693 aa  904    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  44.45 
 
 
2020 aa  879    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.55 
 
 
3670 aa  1510    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.04 
 
 
4575 aa  1345    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  50.51 
 
 
1789 aa  1390    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  55.43 
 
 
3148 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.57 
 
 
2890 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 
3676 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.85 
 
 
2078 aa  1077    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.48 
 
 
3696 aa  876    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.19 
 
 
3493 aa  1262    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.75 
 
 
2277 aa  1309    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
3874 aa  1476    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  51.91 
 
 
1601 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 
1828 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  50.17 
 
 
3408 aa  2003    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.64 
 
 
1071 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  51.82 
 
 
2060 aa  1073    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  74.14 
 
 
3711 aa  4549    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.72 
 
 
7279 aa  2589    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  56.15 
 
 
1548 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.75 
 
 
4151 aa  1483    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.78 
 
 
1837 aa  1151    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.42 
 
 
2374 aa  869    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.08 
 
 
3702 aa  900    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.95 
 
 
2880 aa  756    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  52.39 
 
 
3355 aa  1757    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.27 
 
 
4183 aa  889    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  45.81 
 
 
3400 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.42 
 
 
1867 aa  1323    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.37 
 
 
3427 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  52.92 
 
 
1955 aa  892    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  54.7 
 
 
4080 aa  2326    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.3 
 
 
3679 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.73 
 
 
1804 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  48.18 
 
 
2024 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.61 
 
 
1559 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
7110 aa  2872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>