More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4135 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.42 
 
 
1909 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  48.28 
 
 
1573 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  47.16 
 
 
3463 aa  1024    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.4 
 
 
2126 aa  1582    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  40.77 
 
 
1616 aa  948    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.96 
 
 
5400 aa  1035    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.06 
 
 
3033 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  36.16 
 
 
1966 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  56.72 
 
 
1584 aa  969    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  43.83 
 
 
2024 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
2367 aa  1382    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  50.6 
 
 
1114 aa  854    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.19 
 
 
2719 aa  1471    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.78 
 
 
2066 aa  862    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.77 
 
 
2847 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  54.54 
 
 
1143 aa  871    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.91 
 
 
1816 aa  999    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
1837 aa  927    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  43.81 
 
 
2107 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.89 
 
 
3148 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
2551 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
1874 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.41 
 
 
1867 aa  1063    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  46.38 
 
 
2020 aa  1551    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 
1587 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  49.47 
 
 
3493 aa  987    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  47.9 
 
 
4080 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.39 
 
 
4183 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.17 
 
 
4882 aa  928    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 
2333 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.32 
 
 
4575 aa  1404    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  47.48 
 
 
3281 aa  748    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  48.19 
 
 
5255 aa  1135    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.38 
 
 
1955 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  48.68 
 
 
1548 aa  781    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.42 
 
 
1602 aa  1206    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  52.94 
 
 
3158 aa  1091    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  45.76 
 
 
2081 aa  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  100 
 
 
2108 aa  4179    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.23 
 
 
3874 aa  1450    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.63 
 
 
3101 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.58 
 
 
3092 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  48.21 
 
 
1831 aa  1092    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.4 
 
 
5154 aa  1035    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.97 
 
 
2966 aa  1127    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.64 
 
 
3693 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.48 
 
 
2078 aa  777    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  43.88 
 
 
2113 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.49 
 
 
3930 aa  1309    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.98 
 
 
6768 aa  1646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  38.69 
 
 
2085 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  49.59 
 
 
3355 aa  1107    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.3 
 
 
7279 aa  1137    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.23 
 
 
1820 aa  1045    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.82 
 
 
3508 aa  1122    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  46.94 
 
 
1077 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  55.04 
 
 
1305 aa  922    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.67 
 
 
2060 aa  1403    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  37.88 
 
 
2220 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  47.86 
 
 
4111 aa  1014    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  49.96 
 
 
1924 aa  1030    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.05 
 
 
2136 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.04 
 
 
2090 aa  1047    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.01 
 
 
1832 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.64 
 
 
3693 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.14 
 
 
2376 aa  718    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  48.47 
 
 
4607 aa  1553    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.54 
 
 
3449 aa  964    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.93 
 
 
3408 aa  1139    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  38.69 
 
 
2085 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  54.06 
 
 
1601 aa  906    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 
3676 aa  683    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  47.37 
 
 
2846 aa  1008    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.61 
 
 
3696 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.69 
 
 
1071 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 
1805 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.17 
 
 
1101 aa  870    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.28 
 
 
3670 aa  1077    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  48.56 
 
 
1789 aa  1081    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  56.56 
 
 
3254 aa  881    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 
1939 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.11 
 
 
3711 aa  1038    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  51.36 
 
 
7210 aa  1225    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 
2232 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.67 
 
 
2230 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  33.32 
 
 
2604 aa  833    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  47.94 
 
 
3494 aa  1108    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  49.1 
 
 
2374 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.38 
 
 
3702 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.35 
 
 
2890 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.98 
 
 
2225 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.85 
 
 
7110 aa  1207    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  38.69 
 
 
2085 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  54.01 
 
 
1593 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  47.74 
 
 
4930 aa  1043    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  47.67 
 
 
4151 aa  1628    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.33 
 
 
1804 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.82 
 
 
3679 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.42 
 
 
3176 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.73 
 
 
4840 aa  923    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>