More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1250 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.26 
 
 
2890 aa  780    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.26 
 
 
7279 aa  2836    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.69 
 
 
1559 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  55.49 
 
 
1601 aa  868    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  53.31 
 
 
1602 aa  1170    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  56.62 
 
 
1143 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  50.27 
 
 
3463 aa  2747    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  46.43 
 
 
1402 aa  721    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  54.43 
 
 
1955 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  50.95 
 
 
1924 aa  1338    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.7 
 
 
2719 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.07 
 
 
2066 aa  1138    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  55.59 
 
 
1548 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  40.41 
 
 
2762 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.5 
 
 
2966 aa  1835    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  57.27 
 
 
1584 aa  923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.62 
 
 
1827 aa  716    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 
2462 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.14 
 
 
2060 aa  1000    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
2551 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
1874 aa  938    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.88 
 
 
1656 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  48.47 
 
 
4607 aa  1070    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 
1587 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  51.12 
 
 
2024 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  64.13 
 
 
5255 aa  3974    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  51.3 
 
 
3158 aa  1343    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.41 
 
 
2232 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  55.42 
 
 
2374 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.08 
 
 
4183 aa  857    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  51.96 
 
 
3355 aa  1779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.67 
 
 
5400 aa  2734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.38 
 
 
1349 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  32.48 
 
 
1835 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  55.2 
 
 
2376 aa  850    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  51.6 
 
 
2081 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.37 
 
 
2846 aa  1296    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.76 
 
 
2880 aa  764    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  67.35 
 
 
1831 aa  2094    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.99 
 
 
3508 aa  2531    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  53.56 
 
 
1071 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.37 
 
 
1939 aa  823    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 
3693 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.38 
 
 
7210 aa  3006    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  50.83 
 
 
6768 aa  1474    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  48.26 
 
 
2113 aa  1258    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
1816 aa  1426    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  37.5 
 
 
2085 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.53 
 
 
1804 aa  673    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.23 
 
 
4151 aa  1455    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.08 
 
 
2551 aa  703    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.22 
 
 
2107 aa  1248    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 
1354 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  53.07 
 
 
1114 aa  882    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  51.27 
 
 
4080 aa  2202    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.93 
 
 
2126 aa  1198    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 
5154 aa  2318    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  47.23 
 
 
4930 aa  2414    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.32 
 
 
1832 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.71 
 
 
4478 aa  769    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 
2230 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.12 
 
 
4575 aa  1244    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 
3693 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  48.24 
 
 
3033 aa  955    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  53.51 
 
 
3408 aa  2288    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  47.18 
 
 
2847 aa  1196    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.57 
 
 
2090 aa  1244    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
2085 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.47 
 
 
1349 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 
3676 aa  804    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.87 
 
 
1867 aa  1369    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.2 
 
 
3696 aa  784    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  55.45 
 
 
1593 aa  823    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 
1805 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.38 
 
 
1837 aa  1147    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
7110 aa  3023    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.98 
 
 
1828 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  52.04 
 
 
3254 aa  1067    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.66 
 
 
4111 aa  1931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  64.76 
 
 
1789 aa  1990    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.04 
 
 
3645 aa  766    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.89 
 
 
1087 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  100 
 
 
3494 aa  6803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  45.04 
 
 
3493 aa  1457    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  44.98 
 
 
4840 aa  2368    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  38.01 
 
 
3101 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 
3702 aa  794    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  49.93 
 
 
3711 aa  2784    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  45.89 
 
 
3670 aa  1368    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.28 
 
 
3176 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  38.23 
 
 
2085 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.69 
 
 
1559 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 
2333 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 
3092 aa  987    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  50.98 
 
 
2367 aa  1129    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 
3679 aa  801    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.2 
 
 
3449 aa  1387    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.35 
 
 
1820 aa  1284    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  46.47 
 
 
3148 aa  1429    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.44 
 
 
2225 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>