More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4837 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 
4111 aa  1045    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  55.79 
 
 
3158 aa  1084    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  49.11 
 
 
7210 aa  1404    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.21 
 
 
4840 aa  1130    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53 
 
 
1593 aa  833    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 
1832 aa  744    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  52.34 
 
 
3148 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  43.82 
 
 
2107 aa  1060    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.1 
 
 
1867 aa  994    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.5 
 
 
3033 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.26 
 
 
3711 aa  1283    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.82 
 
 
3463 aa  1264    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1924 aa  3647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.62 
 
 
3494 aa  1399    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  45.37 
 
 
1602 aa  971    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.49 
 
 
2719 aa  924    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.81 
 
 
2066 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.27 
 
 
7279 aa  1351    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.24 
 
 
3355 aa  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.6 
 
 
1126 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  48.99 
 
 
1114 aa  792    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.42 
 
 
5154 aa  1298    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
1874 aa  844    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  44.67 
 
 
2090 aa  1161    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  44.46 
 
 
1077 aa  662    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.63 
 
 
3493 aa  1153    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 
2232 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  46.51 
 
 
1071 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  47.97 
 
 
1548 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  46.95 
 
 
2376 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.84 
 
 
2890 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  54.19 
 
 
1143 aa  849    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 
3176 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  45.55 
 
 
1955 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  61.75 
 
 
4930 aa  1769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  46.51 
 
 
2081 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.16 
 
 
7110 aa  1357    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.84 
 
 
5255 aa  1448    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.81 
 
 
4575 aa  1069    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  49.64 
 
 
4151 aa  1072    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.13 
 
 
3508 aa  1272    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 
3693 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  42.15 
 
 
4183 aa  712    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  49.34 
 
 
2966 aa  1014    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  47.25 
 
 
4080 aa  1223    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.29 
 
 
3449 aa  1184    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.77 
 
 
2277 aa  1237    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.56 
 
 
1101 aa  755    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
3092 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  44.1 
 
 
3281 aa  656    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  54.7 
 
 
1789 aa  1131    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
5400 aa  1243    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.88 
 
 
1305 aa  788    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.61 
 
 
2126 aa  1049    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.23 
 
 
4264 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  44.59 
 
 
2060 aa  842    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  50.95 
 
 
1601 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 
3693 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.07 
 
 
1820 aa  1263    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  51.89 
 
 
6768 aa  1133    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.01 
 
 
3670 aa  1076    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
3874 aa  1236    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  42.71 
 
 
4882 aa  1162    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.56 
 
 
3676 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  44.83 
 
 
2847 aa  1071    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.67 
 
 
3696 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  46.49 
 
 
1573 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
1837 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.48 
 
 
2078 aa  910    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 
1816 aa  1301    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  44.37 
 
 
2367 aa  920    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.67 
 
 
2846 aa  1176    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.58 
 
 
2374 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.36 
 
 
1584 aa  864    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  47.52 
 
 
2108 aa  1089    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.32 
 
 
1559 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.72 
 
 
1831 aa  1406    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.11 
 
 
1939 aa  734    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 
3702 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.54 
 
 
2136 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  50.21 
 
 
3408 aa  1343    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.29 
 
 
4607 aa  940    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  44.9 
 
 
2020 aa  930    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.49 
 
 
3254 aa  838    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.6 
 
 
2230 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 
3679 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  43.75 
 
 
2113 aa  1065    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.38 
 
 
2225 aa  646    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.53 
 
 
3930 aa  1257    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 
1587 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.17 
 
 
1559 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
2551 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  43.97 
 
 
2024 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.13 
 
 
1349 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.12 
 
 
2085 aa  626  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.12 
 
 
2085 aa  626  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.65 
 
 
1349 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.12 
 
 
2085 aa  625  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
2333 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  35.95 
 
 
2220 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>