More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3819 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  39.91 
 
 
1548 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  39.23 
 
 
1582 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 
5400 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  47.73 
 
 
1337 aa  867    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  27.28 
 
 
2500 aa  824    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  29.03 
 
 
2543 aa  1016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  36.08 
 
 
3494 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  38.75 
 
 
3254 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.46 
 
 
1349 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  41.1 
 
 
3099 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
1837 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.86 
 
 
1867 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  30.78 
 
 
2546 aa  988    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  29.36 
 
 
2476 aa  936    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  32.18 
 
 
2225 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 
4882 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  40.28 
 
 
1424 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
2551 aa  878    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
1874 aa  1036    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  48.66 
 
 
1656 aa  895    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.48 
 
 
1144 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  45.25 
 
 
1587 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  39.87 
 
 
1646 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  30.88 
 
 
2546 aa  989    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 
1939 aa  783    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 
7279 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.05 
 
 
3645 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  30.8 
 
 
2545 aa  993    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
1816 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.59 
 
 
3252 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  38.53 
 
 
1574 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.41 
 
 
1822 aa  710    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  29.79 
 
 
2543 aa  1031    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
7110 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  34.7 
 
 
3111 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  32.99 
 
 
2890 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
2333 aa  1111    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  29.44 
 
 
2485 aa  931    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.72 
 
 
2230 aa  749    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 
2544 aa  1009    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.29 
 
 
3693 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.6 
 
 
1101 aa  674    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  41.59 
 
 
3337 aa  722    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  42.82 
 
 
2462 aa  1024    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  34.47 
 
 
3424 aa  732    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.67 
 
 
4183 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  30.26 
 
 
2499 aa  1016    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  31.01 
 
 
2545 aa  996    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2551 aa  5229    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  45.9 
 
 
1909 aa  1092    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  52.03 
 
 
1354 aa  952    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 
2762 aa  892    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  29.47 
 
 
2547 aa  1032    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 
2367 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.87 
 
 
4478 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  31.05 
 
 
2544 aa  1009    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 
2047 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.29 
 
 
3693 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.38 
 
 
3930 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 
1653 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.16 
 
 
3427 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  33.69 
 
 
4151 aa  675    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  50 
 
 
866 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.35 
 
 
2136 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.85 
 
 
3676 aa  773    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  38.66 
 
 
2477 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.41 
 
 
3696 aa  747    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  48.42 
 
 
1559 aa  891    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.18 
 
 
1372 aa  734    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.99 
 
 
3101 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  33.01 
 
 
1832 aa  697    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 
5154 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  40.41 
 
 
1349 aa  878    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  33.7 
 
 
2134 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  30.82 
 
 
2546 aa  989    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  39.53 
 
 
2604 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 
3099 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  30.82 
 
 
2546 aa  989    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  30.78 
 
 
2546 aa  988    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 
7210 aa  737    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  30.96 
 
 
1966 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.06 
 
 
2880 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  31.05 
 
 
2546 aa  989    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.27 
 
 
3702 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.09 
 
 
950 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 
2232 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.63 
 
 
3176 aa  933    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.73 
 
 
1909 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  39.58 
 
 
3045 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.31 
 
 
1559 aa  890    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  48.44 
 
 
1087 aa  926    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  30.82 
 
 
2546 aa  989    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.5 
 
 
3679 aa  757    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.56 
 
 
1795 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  39.42 
 
 
1208 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.21 
 
 
4080 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.96 
 
 
1804 aa  738    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  31.96 
 
 
3711 aa  635  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.31 
 
 
6889 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 
2498 aa  637  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>