More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4443 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  45.92 
 
 		 4151 aa  1047    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.43 
 
 		 2126 aa  916    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.98 
 
 		 1955 aa  747    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  45.54 
 
 		 6768 aa  929    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  45.04 
 
 		 3158 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.27 
 
 		 1827 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.02 
 
 		 1832 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.36 
 
 		 2376 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  47.9 
 
 		 2966 aa  1148    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  49.03 
 
 		 3670 aa  1320    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 		 3176 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.99 
 
 		 1867 aa  1124    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  38.81 
 
 		 2719 aa  1055    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.47 
 
 		 2066 aa  1087    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  47.11 
 
 		 3463 aa  1279    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  43.74 
 
 		 1114 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  46.52 
 
 		 3711 aa  1256    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 		 7110 aa  1379    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.2 
 
 		 3508 aa  1184    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 2551 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.39 
 
 		 4882 aa  1268    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 		 1548 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  43.59 
 
 		 1789 aa  1118    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.2 
 
 		 5255 aa  1107    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  45.82 
 
 		 1584 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.6 
 
 		 1939 aa  732    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  39.39 
 
 		 4264 aa  1082    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  45.64 
 
 		 7279 aa  1780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.66 
 
 		 2078 aa  930    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  45.79 
 
 		 2081 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.13 
 
 		 5400 aa  1342    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 		 3092 aa  860    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  49.01 
 
 		 2107 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.58 
 
 		 7210 aa  1398    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.59 
 
 		 3693 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.81 
 
 		 4840 aa  1387    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.47 
 
 		 1837 aa  1033    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  46.15 
 
 		 1601 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.14 
 
 		 1101 aa  781    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  46.73 
 
 		 1602 aa  961    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.37 
 
 		 3930 aa  1168    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 		 4930 aa  1036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.95 
 
 		 3254 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.27 
 
 		 3355 aa  1109    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.33 
 
 		 4575 aa  1120    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  45.05 
 
 		 2060 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  42.63 
 
 		 1831 aa  1062    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.06 
 
 		 4478 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  48.2 
 
 		 3033 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.62 
 
 		 2374 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 		 5154 aa  1097    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.59 
 
 		 3693 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  50.8 
 
 		 1071 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.07 
 
 		 3874 aa  1120    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.3 
 
 		 2113 aa  1105    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  50.31 
 
 		 1126 aa  767    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  42.74 
 
 		 2020 aa  832    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  51.11 
 
 		 4080 aa  1768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  40.17 
 
 		 3449 aa  1094    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.98 
 
 		 2024 aa  733    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 3676 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.1 
 
 		 3696 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.79 
 
 		 1805 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.06 
 
 		 2846 aa  1811    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  51.03 
 
 		 2666 aa  1235    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 		 1816 aa  1315    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.81 
 
 		 3148 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  46.71 
 
 		 3494 aa  1184    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  41.27 
 
 		 1402 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 		 3493 aa  1057    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  45.71 
 
 		 3408 aa  1094    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  100 
 
 		 2847 aa  5412    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.76 
 
 		 3702 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  43.25 
 
 		 4111 aa  868    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  43.87 
 
 		 4607 aa  812    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  43.4 
 
 		 2277 aa  1436    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  43.93 
 
 		 1924 aa  1021    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.17 
 
 		 3645 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  41.87 
 
 		 2108 aa  840    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 		 3679 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  43.14 
 
 		 1820 aa  1093    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.1 
 
 		 1305 aa  637  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  35.76 
 
 		 1349 aa  633  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 		 1874 aa  633  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 		 1587 aa  630  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  45.15 
 
 		 1143 aa  630  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.76 
 
 		 1349 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.07 
 
 		 1087 aa  624  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.98 
 
 		 2232 aa  618  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 1656 aa  616  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  43.09 
 
 		 3281 aa  617  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 		 1559 aa  613  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.82 
 
 		 1559 aa  613  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.23 
 
 		 3111 aa  612  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  42.95 
 
 		 3400 aa  613  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  37.43 
 
 		 1354 aa  612  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.73 
 
 		 2551 aa  609  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  41.17 
 
 		 2090 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  35.31 
 
 		 2230 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 		 2333 aa  592  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>