More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2684 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  57.04 
 
 
3711 aa  3655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.44 
 
 
3033 aa  1085    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  53.29 
 
 
1584 aa  798    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.42 
 
 
3408 aa  2170    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.43 
 
 
3508 aa  2416    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  51.83 
 
 
7210 aa  4470    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.05 
 
 
3874 aa  1526    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.34 
 
 
1349 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.51 
 
 
1820 aa  1287    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.12 
 
 
1816 aa  1691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  55.31 
 
 
4151 aa  1599    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.78 
 
 
2719 aa  1012    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  42.82 
 
 
2066 aa  1301    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  57.8 
 
 
1548 aa  950    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  35.25 
 
 
2134 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
1832 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  50.41 
 
 
2126 aa  1080    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.01 
 
 
3148 aa  1529    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46 
 
 
1924 aa  1200    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
2551 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
1874 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.25 
 
 
1656 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.78 
 
 
4607 aa  915    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.38 
 
 
1587 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.6 
 
 
4575 aa  1422    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.79 
 
 
5154 aa  2350    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  46.33 
 
 
3158 aa  1122    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.12 
 
 
2846 aa  1210    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.55 
 
 
7110 aa  4586    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  48.77 
 
 
1143 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.49 
 
 
3252 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.52 
 
 
7279 aa  3642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  48.15 
 
 
4840 aa  2580    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 
2762 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  55.99 
 
 
3463 aa  3190    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  52.56 
 
 
2081 aa  947    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.68 
 
 
3111 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.42 
 
 
2966 aa  1831    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.01 
 
 
1337 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.34 
 
 
6768 aa  1285    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.5 
 
 
2230 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 
3645 aa  1590    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.01 
 
 
3693 aa  915    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 
3092 aa  1335    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.15 
 
 
3176 aa  807    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  56.03 
 
 
4080 aa  2617    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 
1939 aa  823    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.44 
 
 
2113 aa  1363    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.28 
 
 
2090 aa  1348    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.72 
 
 
1827 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.33 
 
 
2551 aa  734    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  35.7 
 
 
1909 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.91 
 
 
1354 aa  707    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  43 
 
 
4111 aa  1981    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  52.51 
 
 
3355 aa  1799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  52.75 
 
 
2376 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  49.51 
 
 
2107 aa  1268    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  52.8 
 
 
1955 aa  926    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  48.23 
 
 
1616 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.53 
 
 
4478 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.64 
 
 
1087 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.27 
 
 
4930 aa  2481    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.01 
 
 
3693 aa  915    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45.55 
 
 
1402 aa  783    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  35.6 
 
 
1349 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 
2232 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.08 
 
 
2333 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.34 
 
 
2847 aa  1337    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.61 
 
 
4183 aa  920    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 
3676 aa  869    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  44.7 
 
 
2477 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.52 
 
 
3696 aa  838    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.99 
 
 
3254 aa  1235    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.45 
 
 
1805 aa  757    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  53.38 
 
 
1601 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  48.54 
 
 
5255 aa  3935    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.47 
 
 
3493 aa  1319    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.32 
 
 
2462 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  52.4 
 
 
1593 aa  783    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  48.74 
 
 
1831 aa  1316    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  53.05 
 
 
1602 aa  1173    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.01 
 
 
3494 aa  2801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  49.97 
 
 
1789 aa  1354    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  48.17 
 
 
2024 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  37.03 
 
 
2604 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 
3101 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.69 
 
 
3702 aa  904    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.62 
 
 
1559 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 
1837 aa  1218    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  55 
 
 
2374 aa  959    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  50.46 
 
 
3670 aa  1603    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.08 
 
 
1559 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  41.45 
 
 
2047 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
5400 aa  10510    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  52.58 
 
 
2367 aa  1214    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 
3679 aa  856    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  46.85 
 
 
3400 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  51.07 
 
 
2060 aa  1092    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 
1806 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.93 
 
 
2880 aa  800    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>