More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3476 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.44 
 
 		 3033 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 		 7210 aa  1073    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 1816 aa  1133    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  48 
 
 		 1126 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 5154 aa  842    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.73 
 
 		 3670 aa  898    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  44.2 
 
 		 1114 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  41.93 
 
 		 4575 aa  926    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  47.41 
 
 		 1955 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.9 
 
 		 2719 aa  747    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  37.51 
 
 		 2066 aa  968    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  40.23 
 
 		 3281 aa  897    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  45.16 
 
 		 1143 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42 
 
 		 3463 aa  1008    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  48.88 
 
 		 1548 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.09 
 
 		 3508 aa  886    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 2551 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 1874 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  39.56 
 
 		 2108 aa  785    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  40.71 
 
 		 7279 aa  991    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.93 
 
 		 1831 aa  928    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 		 1924 aa  857    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  41.04 
 
 		 2107 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.8 
 
 		 3449 aa  860    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.46 
 
 		 5255 aa  967    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 		 1789 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  41.83 
 
 		 3711 aa  1229    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  46.61 
 
 		 1593 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  38.5 
 
 		 3930 aa  961    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 		 2081 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.39 
 
 		 3645 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.81 
 
 		 3254 aa  777    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  42.48 
 
 		 3408 aa  962    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  45.05 
 
 		 3158 aa  780    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.02 
 
 		 2113 aa  1001    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  37.98 
 
 		 2846 aa  836    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  41.59 
 
 		 6768 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  100 
 
 		 2078 aa  4069    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  44.17 
 
 		 4080 aa  1082    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.51 
 
 		 4882 aa  1048    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  40.62 
 
 		 1354 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  45.55 
 
 		 1584 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  47.5 
 
 		 2376 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.21 
 
 		 2367 aa  873    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.42 
 
 		 3493 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  44.59 
 
 		 2966 aa  822    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  42.63 
 
 		 4151 aa  890    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 		 4111 aa  754    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  40.38 
 
 		 2847 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.59 
 
 		 1867 aa  986    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.72 
 
 		 3148 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.94 
 
 		 1305 aa  677    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  41.1 
 
 		 2126 aa  840    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  48.79 
 
 		 2374 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.55 
 
 		 1101 aa  765    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  45.41 
 
 		 2024 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  40.76 
 
 		 1820 aa  720    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 7110 aa  1069    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.11 
 
 		 3092 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  39.68 
 
 		 4930 aa  856    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  41.55 
 
 		 3494 aa  994    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 		 4840 aa  953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  38.87 
 
 		 4607 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  45.33 
 
 		 1601 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  39.8 
 
 		 2277 aa  932    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  45.32 
 
 		 1602 aa  884    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  38.82 
 
 		 2090 aa  1064    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 3874 aa  895    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.76 
 
 		 1071 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  41.22 
 
 		 2060 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 5400 aa  1174    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  40.37 
 
 		 2020 aa  632  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.25 
 
 		 1349 aa  633  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.42 
 
 		 3176 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.16 
 
 		 1349 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39 
 
 		 1587 aa  629  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 		 3693 aa  616  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 		 3693 aa  616  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.39 
 
 		 3702 aa  613  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.52 
 
 		 1087 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.41 
 
 		 3676 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.54 
 
 		 3679 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.47 
 
 		 1402 aa  601  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  36.95 
 
 		 1559 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  40.97 
 
 		 1573 aa  600  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.3 
 
 		 1559 aa  596  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.12 
 
 		 1656 aa  596  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 3696 aa  595  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.42 
 
 		 4478 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.83 
 
 		 2890 aa  592  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  41.81 
 
 		 4264 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.77 
 
 		 1372 aa  580  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  37.94 
 
 		 2762 aa  580  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  36.98 
 
 		 1805 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.9 
 
 		 2880 aa  576  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.8 
 
 		 2462 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  38.08 
 
 		 2047 aa  568  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.21 
 
 		 2136 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.02 
 
 		 2551 aa  565  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  36.79 
 
 		 1827 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>