Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Strop_2781 |
Symbol | |
ID | 5059244 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Salinispora tropica CNB-440 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_009380 |
Strand | - |
Start bp | 3174833 |
End bp | 3185224 |
Gene Length | 10392 bp |
Protein Length | 3463 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 70% |
IMG OID | 640475035 |
Product | beta-ketoacyl synthase |
Protein accession | YP_001159601 |
Protein GI | 145595304 |
COG category | [I] Lipid transport and metabolism [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism [R] General function prediction only |
COG ID | [COG1028] Dehydrogenases with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenases) [COG3321] Polyketide synthase modules and related proteins |
TIGRFAM ID | [TIGR00128] malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 13 |
Fosmid unclonability p-value | 1 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGGAGAACG AGGAGAAGCT TCTCGGGTAC CTGAAGCGGG CCACCATAGA TCTGCGTGAG GCCCGCCGGC AGCTACGCAA CGCCGAGCTC CGAGAGTACG ACCCGATCGC GATCGTCGGT ATGAGCTGCC GATTTCCGGG CGGCGTGGAC AGTCCGGCGG CGCTGTGGCA GCTCCTCGCC GACGGTGCCG ACGCCATCTC CGACTTCCCC AACGACCGGG GTTGGAACAT CGAGGACATC TACGACCCCG ACCATTCCAA GGCCGGCAAG ACGTACACGA GGAGCGGTGG GTTCCTCTCC GACGCCGCGC TTTTCGACCC TGAGTTCTTC GGCATTTCGC CGCGTGAGGC GATCGCCATG GACCCGCAGC AACGGCTGTT GCTGGAGGCG TCCTGGGAGG CGTTCGAGTC GGCCGGCATC GACCCGGTCT CGATGCGCGG TAGCCGCACC GGTGTGTTCG CCGGGCTCAT GTACCACGAC TACTCGACCC GGCTGCCGAC GGTGCCCGCC GAGTTGGAGG GCTTTCTCGG CAACGGCAAC GCCGGCAGTA TCTTCTCCGG CCGGGTCGCG TACGTGCTGG GCCTGGAGGG TCCGGCGATC ACCGTGGATA CCGCTTGTTC GTCGTCACTG GTCGCGCTGC ACCTGGCGAT CCAGGCGCTG CGCCGTGAGG AGTGCACCCT GGCGCTGGCC GGCGGCGCGA CGGTGATGGC CACCCCGGAG ACGTTCGTCG ACTTCAGCCG GCAACGAGGT CTGGCCTCCG ACGGTCGATG CAAGCCGTTC GCCGCCGCCG CCGACGGCAC CGGATGGGCC GAGGGCGTCG GTGTGCTGCT CGTCGAGCGA CTCAGCGACG CCCAGCGCAA CGGGCACCGG GTGCTGGCCG TCGTACGCGG 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ACGACCGGCT GCTCGACCAC GGTTACGGCT ACGGGCCGGT GTTCCAGGGG CTGCGCGCGG TGTGGCAGCG CGGCCACGGC GACACCGCCG AGGTCTGGGC CGAGGCGGCG CTGCCCGAGG TGGCCGCCGC CGACGTGCCG CGGTTCCTGC TGCATCCGGC TCTGTTCGAC GCGGCGCTAC ACGCGAACCT CGTAGCCGAA GGCGCCGGCA ACACGCCGTT GCCGTTCTCC TGGCGCGGGG TGACCCTGCA TGCCGCGCAC GCCGCCACTC TGCGGATCCG GATCTTCCCG GCCACCGCCG ACAAGCTGGC CGTCACCGTC GCCGACGGGA ACGGCAACCC CGTCGCCACC ATCGACCAGA TGGTGGCCCG ACCGGTCGCC GCCGACGCAC TCGGGACCGC CGCCCGGGGC CACCGGCGCA ACCTGTTCGA GGTGGCTTGG CAGCCCGTCG CCACCCCGGA CATCGTCGCC GACGACTGGA CCCCCATCGA CGCCGAGGCG GAACTGCCTG ACCCGGCACC CGGCACCGTC GTGGTCACCC TCGACCCGCC CGGTACGCCG CCCGCGGCCG TGCACGCGGC CGCCGAACGA CTGTTGGCGC TGCTGCACCG ATGGCTCACC GAGCCGGGGT ACGCCGCGGC GACGCTGGTG CTGCATACCC GCGATGCGGT CGGTGCCGGC GACACCCCGG TCAACCCTGC CCAAGCGGCC CTGTGGGGGC TGGTCCGGGC CGCCGAGGCC GAACACCCCG GCCGGTTCGT CCTGGTCGAC ACCGACGGCA CCGGCACCGA TCACCTCGCG GCGGCGCTGG CCACCGGGGA ACCGGAGGTG GCCGTCCGGG ACGGTCGACT GCTGGTGCCC CGACTGACCC GGGTACCCGC CGAGGCACCC CGCGACGGCA TCCCGTGGTC 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Protein sequence | MENEEKLLGY LKRATIDLRE ARRQLRNAEL REYDPIAIVG MSCRFPGGVD SPAALWQLLA DGADAISDFP NDRGWNIEDI YDPDHSKAGK TYTRSGGFLS DAALFDPEFF GISPREAIAM DPQQRLLLEA SWEAFESAGI DPVSMRGSRT GVFAGLMYHD YSTRLPTVPA ELEGFLGNGN AGSIFSGRVA YVLGLEGPAI TVDTACSSSL VALHLAIQAL RREECTLALA GGATVMATPE TFVDFSRQRG LASDGRCKPF AAAADGTGWA EGVGVLLVER LSDAQRNGHR VLAVVRGTAV NQDGASSGLT APNGPSQRRV IAEALANARL TTDQVDAVEA HGTGTTLGDP IEAQAIVATY GRDRDRPLWL GSVKSNIGHT QAAAGVAGVI KMVMAMRHGV LPRTLHVDEP TPHVDWSVGD VRLLTDAVEW PVTGRPRRAG VSSFGISGTN AHVVLEQAPL VGDEESVGLV EVVDPPVVLW PVSGRSLEGL AGQAGRVAGF CGGVGVRAVD VGLSLGVGRA GLEFRGVAVG REVSELSAGL EVVAAGGGVS GRVSSGRTAV LFSGQGAQWV GMGRELAGAF PVFAGALAEV CGVFGPLLGG DLREVMFVDG GGVLDRTGWA QPALFAVEVA LFRLAESWGL VPDFVVGHSV GELVAAYVSG VWSLEDACRV VAARGGLMEG LPGGAMLAVG GSVGELELGG VDVAAVNGPR SVVVSGTEEE IAGLEGSLGV WTRRLRVSHA FHSRLMDPMV ADFGRVVGGV RGRVGGVAVV STVTGEVVTD EVLGSVGYWQ GQVRGTVRFA DAVATLVERG VTRFVEVGPD SVLTGLVAEC VPEAAVVVGL QRRGGDQVRA FAAGMGRVWA AGVDLDWAAV HPGGRQVDLP TYAFQHQHYW LYDPALVGAG LLAATHPLLD VTVPLANTDG AVLTGRWSLS THPWLADHTV GGTVVFPGTG LVELALHAGA QVGADLLDEL TLHAPLVVPD SGSVEVQLTV EAPDPTGRRA VAVHSRERDD APWTRHATGV LTAGDTPGVA LTEWPPADAE PLPLTGLYDD LAIGGLDYGH TFQGLRRAWR TGKELYAEVD LPEGTETDGY GLHPALFDAG LHALTRADDD PHRGLPFAWS GVALHATGAT SLRVRLTPSD SSVRIAVADA VGAPVATVRS LVLRPVRVAA ATGVADALFG LDWHPLGITV TGTTPTWTWH PDTTPAPTGD GVTPTTGPGP GDGPPELVVL PAGGTDDVHV EVNRVLAIAQ RWLAGTTTAP LVVLTRGAVG DDVTDLAGAA VWGLLRSAQA ENPDRFLLVD ADTDQLSDVL SLALAAGEPQ VRVRGGVVSV PRLVRQAVAS SSVDASLFGT GVVLVTGATG ALGSVVARHL VAAHGVRRLL LLSRSGMAAS GAADLVAELS AAGARVELAA CDVADRVQLA AVLAGASDLS AVVHTAGVLD DGVVSSLSAA RVSGVLRPKV DAAWLLDELT RDRELSAFVL FSSMSGVLGA PGQGNYAAAN AFLDALAVTR RRAGLPGVSL AWGLWGQGSA MTDRLGDADR ERMARGGVLP LATTDGLALL DAAVANPYPT AVPARLDLAV LRTLGDDLPL PFHGLVRPAR RLAARAAVPN ATGWAADLAA LPADERDRAA TALVLTQVAA VLGHASAERI DAGRPFQELG FDSLTAVELR NALSASTGLR LPATLIFDYP SPRDLARYLL REIAGPDDVD PVPAVTTTTG IDEPVAIVGM ACRYPGGVSS PEDLWRLVVE GVDAIDGFPV DRGWDLDRLY DPSGSRPDTT YVAKGGFLTD AGEFDPVFFG ISPREAVLMD PQQRQLLEVS WEAFERAGID PASVRGSATG VFAGVMYHDY VSGHSAGSVV SGRISYTFGL EGPAVSVDTA CSSSLVAMHL AGQALRSGEC DLALAGGVTV MATPETFVEF SRQRGLAPDG RCKPFAAGAD GTGWSEGVGV LVLERLSDAR RNGHRVYGVV RGSAVNQDGA SNGLTAPNGP AQQRVIRQAL GNAGVSAAEV DVVEAHGTGT TLGDPIEAQA IVATYGRDRD RPLWLGSVKS NIGHTQAAAG VAGVIKMVMA MEHGMVPRTL HVDEPTPHVD WSAGDVRLAI DPVEWPAVDR PRRAGVSSFG ISGTNAHVVL EQAPATAPVV RSGTSPVALW PVSGRSVSGL TAQAASLADF LADADFDPAD VALTLGAGRA ALEHRGVAVG DGVTGLRALA AGQGVHGHLT TGRTAVLFSG QGAQWVGMGR ELAGAFPVFA GALAEVCGVF GPLLGGDLRE VMFVDGGGVL DRTGWAQPAL FAVEVALFRL AESWGLVPDF VVGHSVGELV AAYVSGVWSL EDACRVVAAR GGLMEGLPGG AMLAVGGSVG ELELGGVDVA AVNGPRSVVV SGTEEEIAGL EGSLGVWTRR LRVSHAFHSR LMDPMVADFG RVVGGVRGRV GGVAVVSTVT GEVVTDEVLG SVGYWQGQVR GTVRFADAVA TLVERGVTRF VEVGPDSVLT GLVAECVPEA AVVVGLQRRG GDQVRAFAAG MGRVWAAGVD LDWAAVHPGG RQVDLPTYAF QHQHYWIDAP ADPGDATAMG LNSADHPLLG AVIDLPGTGG VVLTGRLSRT AQPWLADHAV FDTVLVPGTG LVELALRAGD QVGCPVLDEL TIGTPLVLPA EGGLALRVAV DAADDSGART LGIWTRPDDA ADDAGWTRHA EGVLVRQAGA DPAAADLSEW PPPGAEPVDL TGLYDRLLDH GYGYGPVFQG LRAVWQRGHG DTAEVWAEAA LPEVAAADVP RFLLHPALFD AALHANLVAE GAGNTPLPFS WRGVTLHAAH AATLRIRIFP ATADKLAVTV ADGNGNPVAT IDQMVARPVA ADALGTAARG HRRNLFEVAW QPVATPDIVA DDWTPIDAEA ELPDPAPGTV VVTLDPPGTP PAAVHAAAER LLALLHRWLT EPGYAAATLV LHTRDAVGAG DTPVNPAQAA LWGLVRAAEA EHPGRFVLVD TDGTGTDHLA AALATGEPEV AVRDGRLLVP RLTRVPAEAP RDGIPWSADG TVLITGGLGG LGSLVARHLV TRHQVRRLLL TSRSGAMAPG AAELVADLTA AGAEVTVAAC DVADRDALAA LLADLPATHP LTAVVHAAGT AENALVDALT PEQLHRVLRP KVDAAWHLHD LTRDLDLTAF VLFSSSAGWV AGAGQGNYAA ANLFLDALAQ RRRADGLPAT SLAFGLWAAG TGMGGHLDEA DLHRMRRLGM PAMTTDEGLG LFDAAVAADR ATVVPVRVDL DALRRRTDAL PAVLRGLVRV SARPVATGGA TAGGPGLVQR LTGLSDADRD ALLLDLVRTH AAAVLGFPGP ASVEPGRAFK DLGFDSLAAV EFRNVLSTVT GLRLPATLVF DHPEPAALAR ALKADLVAPD ADPADAVLAD LDRLEKTLTG VPTDEHARIT ARLEAVLRGW QDRTGDPDDT RRDYESATDE ELFDVLENEL GIS
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