More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3472 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  49.88 
 
 
2966 aa  1041    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  36.63 
 
 
1827 aa  654    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  48.9 
 
 
1584 aa  912    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  47.12 
 
 
1602 aa  965    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 
3033 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
5400 aa  1999    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
3874 aa  1138    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  40.25 
 
 
4930 aa  1833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  50.42 
 
 
1114 aa  900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.38 
 
 
3494 aa  2032    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  32.82 
 
 
2101 aa  756    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  49.13 
 
 
1143 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
3092 aa  853    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  44.33 
 
 
2719 aa  1625    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.76 
 
 
2066 aa  807    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.77 
 
 
1559 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
1816 aa  1057    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  49.03 
 
 
1071 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  34.47 
 
 
2188 aa  899    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.82 
 
 
2225 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  43.03 
 
 
5154 aa  1941    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.02 
 
 
2551 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
1874 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.3 
 
 
1656 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.52 
 
 
3930 aa  1232    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 
1587 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.02 
 
 
1955 aa  782    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  46.69 
 
 
2374 aa  787    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  41.7 
 
 
1616 aa  1026    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  43.72 
 
 
4151 aa  1115    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 
3645 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.71 
 
 
4183 aa  796    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.22 
 
 
2847 aa  866    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  41.27 
 
 
1924 aa  1066    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  42.57 
 
 
3158 aa  1056    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.23 
 
 
2846 aa  1078    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 
7210 aa  2303    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.51 
 
 
2024 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  45.78 
 
 
2081 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 
7110 aa  2231    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  41.51 
 
 
3508 aa  1169    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  46.44 
 
 
1831 aa  1015    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.8 
 
 
3254 aa  934    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.43 
 
 
4840 aa  1270    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.17 
 
 
2232 aa  1091    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 
3693 aa  1136    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.15 
 
 
2090 aa  1083    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  35.82 
 
 
3427 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.08 
 
 
1559 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  33.67 
 
 
2085 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
3711 aa  2031    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  49.03 
 
 
4575 aa  1006    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  32.95 
 
 
2108 aa  790    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  47.75 
 
 
3148 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  45.95 
 
 
2367 aa  1486    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 
1354 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  45.94 
 
 
2376 aa  770    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  40.93 
 
 
1820 aa  1117    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  47.02 
 
 
1789 aa  1003    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  44.66 
 
 
1548 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  47.04 
 
 
3408 aa  2073    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.48 
 
 
3493 aa  1082    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.19 
 
 
4478 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  50.16 
 
 
1593 aa  846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.37 
 
 
2333 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42.85 
 
 
3463 aa  1990    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 
3693 aa  1136    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.26 
 
 
2136 aa  687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.37 
 
 
1909 aa  742    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
1837 aa  845    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
2085 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  46.59 
 
 
3670 aa  1050    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 
3176 aa  1031    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 
3676 aa  1120    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  46.14 
 
 
6768 aa  1163    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 
3696 aa  1127    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  49.88 
 
 
2126 aa  1087    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 
1805 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.24 
 
 
1867 aa  1073    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  40.07 
 
 
2107 aa  947    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  35.52 
 
 
2890 aa  708    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 
5255 aa  2152    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
4111 aa  8040    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.31 
 
 
1939 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.89 
 
 
3449 aa  1095    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.31 
 
 
2230 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  40.59 
 
 
2060 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.01 
 
 
1832 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  45.41 
 
 
4080 aa  1916    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  44.58 
 
 
7279 aa  1930    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 
3702 aa  1139    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  38.43 
 
 
4882 aa  1499    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.29 
 
 
2113 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  33.71 
 
 
2085 aa  812    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 
1806 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
2880 aa  697    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  33.94 
 
 
2604 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.93 
 
 
4607 aa  925    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  50 
 
 
1601 aa  879    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34 
 
 
3679 aa  1088    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>