More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4133 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.34 
 
 
1584 aa  865    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  45.08 
 
 
4183 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  49.62 
 
 
1820 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  46.75 
 
 
3463 aa  755    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  50.73 
 
 
4575 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.73 
 
 
7279 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
5400 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  46.32 
 
 
3033 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  48.15 
 
 
2719 aa  805    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.49 
 
 
2066 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.33 
 
 
1087 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.67 
 
 
1602 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.97 
 
 
1114 aa  815    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  53.28 
 
 
5255 aa  853    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
2551 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  50.98 
 
 
2090 aa  855    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 
1656 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.37 
 
 
3494 aa  846    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  53.04 
 
 
3408 aa  887    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  49.41 
 
 
3670 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  50.64 
 
 
1593 aa  787    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  43.61 
 
 
2024 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  53.5 
 
 
1601 aa  898    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  50.51 
 
 
3508 aa  827    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  45.31 
 
 
1071 aa  769    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  46.43 
 
 
2060 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.65 
 
 
3711 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.47 
 
 
2081 aa  702    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.16 
 
 
3874 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  51.1 
 
 
1143 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  49.77 
 
 
3148 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  46.67 
 
 
2367 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.9 
 
 
2966 aa  876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  40.64 
 
 
2225 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  44.9 
 
 
2376 aa  755    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  45.43 
 
 
4882 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  53 
 
 
7210 aa  890    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.69 
 
 
6768 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.83 
 
 
4840 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.7 
 
 
1354 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.52 
 
 
2078 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  48.76 
 
 
4930 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  50.47 
 
 
3493 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  47.82 
 
 
3355 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.23 
 
 
7110 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
1816 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.94 
 
 
2890 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  52.45 
 
 
2126 aa  913    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  50.4 
 
 
2020 aa  805    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  48.69 
 
 
3449 aa  822    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
1837 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.97 
 
 
1126 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  34.65 
 
 
1402 aa  678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  50.84 
 
 
1789 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  45.62 
 
 
4264 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  46.99 
 
 
3281 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.62 
 
 
1867 aa  834    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  55.04 
 
 
2108 aa  942    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  51.24 
 
 
2846 aa  802    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  49.04 
 
 
4080 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.72 
 
 
1924 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  43.26 
 
 
1077 aa  701    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.77 
 
 
2107 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  50.78 
 
 
4607 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.52 
 
 
4151 aa  882    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.48 
 
 
2230 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  48.45 
 
 
4111 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  52.09 
 
 
3158 aa  843    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  49.24 
 
 
2277 aa  852    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  44.76 
 
 
2374 aa  751    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  46.84 
 
 
3930 aa  821    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  46.54 
 
 
2113 aa  747    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  41.62 
 
 
2666 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 
1955 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.22 
 
 
1831 aa  813    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  50.91 
 
 
3254 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 
1548 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
3092 aa  742    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  53.1 
 
 
5154 aa  853    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  100 
 
 
1305 aa  2618    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  45.68 
 
 
1573 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.76 
 
 
1101 aa  919    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.45 
 
 
2847 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
1587 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 
2232 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 
1939 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 
3693 aa  619  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 
3693 aa  619  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  38.53 
 
 
1966 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 
3702 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.35 
 
 
2136 aa  616  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 
2333 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 
1144 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.28 
 
 
1909 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.93 
 
 
1349 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 
1805 aa  612  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.71 
 
 
1349 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  41.79 
 
 
2085 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.12 
 
 
4478 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.05 
 
 
3176 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>