More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1003 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 		 3711 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  38.44 
 
 		 1955 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 5400 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  43.6 
 
 		 3148 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.06 
 
 		 2719 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  36.09 
 
 		 2066 aa  675    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  36.94 
 
 		 1559 aa  980    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  41.84 
 
 		 2367 aa  706    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  39.19 
 
 		 3781 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.72 
 
 		 1831 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  39.62 
 
 		 3780 aa  675    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.72 
 
 		 1349 aa  830    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 		 1548 aa  760    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 2551 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 1874 aa  951    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  45.2 
 
 		 1656 aa  854    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  42.87 
 
 		 1144 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  47.1 
 
 		 1587 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 3874 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.92 
 
 		 3130 aa  1245    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  36.07 
 
 		 4930 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  36.25 
 
 		 2188 aa  965    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.07 
 
 		 3508 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  42.9 
 
 		 2047 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.45 
 
 		 3252 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 3090 aa  1026    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  38.77 
 
 		 6768 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.55 
 
 		 2108 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  40.17 
 
 		 3033 aa  1401    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 		 2081 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.56 
 
 		 3111 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  41.22 
 
 		 4165 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 7110 aa  836    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 		 3108 aa  976    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.73 
 
 		 4151 aa  890    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  43.15 
 
 		 2374 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  69.07 
 
 		 3693 aa  4942    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  40.51 
 
 		 2376 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 		 1520 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 		 2232 aa  1136    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  38.51 
 
 		 1593 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.3 
 
 		 2085 aa  872    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  37.11 
 
 		 1601 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.96 
 
 		 1537 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.82 
 
 		 2551 aa  778    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  32.4 
 
 		 1909 aa  732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  44.02 
 
 		 1354 aa  801    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.78 
 
 		 3494 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  40.87 
 
 		 2966 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  37.47 
 
 		 1584 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3089 aa  1013    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  41.36 
 
 		 7279 aa  1405    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.14 
 
 		 3158 aa  893    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 		 3254 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.4 
 
 		 4478 aa  1087    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  41.84 
 
 		 1602 aa  711    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 		 2230 aa  1105    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 		 2333 aa  723    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  69.07 
 
 		 3693 aa  4942    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.16 
 
 		 3099 aa  977    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 		 1520 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  33.32 
 
 		 4646 aa  1019    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  38.56 
 
 		 4575 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.3 
 
 		 2085 aa  872    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.34 
 
 		 1816 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  68.96 
 
 		 3676 aa  4922    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  68.17 
 
 		 2477 aa  1253    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 3696 aa  7366    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.47 
 
 		 1832 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.95 
 
 		 1805 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 		 3092 aa  1491    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  40.14 
 
 		 1581 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 1828 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  33.82 
 
 		 2111 aa  844    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  36.39 
 
 		 2024 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 		 3645 aa  877    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.72 
 
 		 2126 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  42.42 
 
 		 3408 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.98 
 
 		 3176 aa  1296    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  41.8 
 
 		 3099 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 5154 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  34.12 
 
 		 2126 aa  851    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.82 
 
 		 2880 aa  936    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  69.06 
 
 		 3702 aa  4950    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 3463 aa  880    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.66 
 
 		 1939 aa  788    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 		 2462 aa  817    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.38 
 
 		 2085 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  35.3 
 
 		 4111 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  38.93 
 
 		 1789 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  38.3 
 
 		 5255 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.58 
 
 		 1087 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  68.01 
 
 		 3679 aa  4793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 		 4840 aa  824    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  37.42 
 
 		 2604 aa  1077    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  35.66 
 
 		 1806 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  45.28 
 
 		 1337 aa  776    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  37.3 
 
 		 2090 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 		 2762 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.84 
 
 		 1827 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>