More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12946 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.09 
 
 
6768 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  53.48 
 
 
1577 aa  1467    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  34.77 
 
 
3033 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  42.27 
 
 
2225 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  44.4 
 
 
2126 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
2232 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  44.47 
 
 
2111 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  43.1 
 
 
2108 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  44.92 
 
 
2101 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.91 
 
 
1559 aa  715    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  54.85 
 
 
1822 aa  1365    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
2551 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  44.27 
 
 
1656 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.96 
 
 
1587 aa  658    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  46.14 
 
 
2220 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
2230 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.35 
 
 
2762 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  30.79 
 
 
1559 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  44.36 
 
 
2111 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  34.71 
 
 
1601 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  65.47 
 
 
2188 aa  1098    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  43.54 
 
 
1076 aa  643    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.04 
 
 
4165 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  33.95 
 
 
1955 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.25 
 
 
2136 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
3092 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.82 
 
 
3693 aa  730    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  52.82 
 
 
1520 aa  1412    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  50.92 
 
 
1190 aa  1004    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  55.38 
 
 
1580 aa  1508    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  44.31 
 
 
2085 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  41.92 
 
 
1704 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  63.79 
 
 
1827 aa  1098    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  45.11 
 
 
2162 aa  695    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  61.86 
 
 
1806 aa  1127    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
2880 aa  744    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  35.17 
 
 
1584 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.82 
 
 
3693 aa  730    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  52.82 
 
 
1520 aa  1412    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  50.92 
 
 
1190 aa  1004    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  55.38 
 
 
1580 aa  1508    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  44.31 
 
 
2085 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  41.92 
 
 
1704 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.41 
 
 
3676 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.99 
 
 
3696 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  62.49 
 
 
1805 aa  1139    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  54.42 
 
 
1812 aa  1357    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  54.5 
 
 
1581 aa  1484    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  55.31 
 
 
1828 aa  936    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  70.39 
 
 
1876 aa  1193    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  53.14 
 
 
1823 aa  916    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  100 
 
 
1537 aa  3095    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.32 
 
 
3427 aa  698    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
1939 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.9 
 
 
3702 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  51.06 
 
 
1190 aa  1005    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  55.32 
 
 
1580 aa  1491    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  44.19 
 
 
2085 aa  685    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  43.63 
 
 
1704 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 
3679 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 
1698 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  43.24 
 
 
1263 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  32.99 
 
 
2081 aa  632  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.68 
 
 
2333 aa  629  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.71 
 
 
2890 aa  629  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.34 
 
 
2126 aa  629  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.28 
 
 
3424 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  40 
 
 
1966 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 
1832 aa  622  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 
1744 aa  623  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  41.61 
 
 
1832 aa  618  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  33.77 
 
 
3281 aa  619  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.93 
 
 
1372 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.21 
 
 
950 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.61 
 
 
1087 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  34.14 
 
 
1548 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 
1144 aa  612  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  32.58 
 
 
3130 aa  613  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.81 
 
 
7279 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  40.02 
 
 
1835 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  33 
 
 
3158 aa  605  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.47 
 
 
1909 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.63 
 
 
1349 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  40.65 
 
 
2108 aa  598  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.41 
 
 
1349 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
7110 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
1874 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.63 
 
 
1804 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  44.04 
 
 
1819 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 
3176 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  41.43 
 
 
2966 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.15 
 
 
1305 aa  586  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  42.44 
 
 
7210 aa  582  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.85 
 
 
1867 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  40.96 
 
 
3101 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  40.51 
 
 
2277 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  37.28 
 
 
1704 aa  582  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  42.32 
 
 
1593 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  40.33 
 
 
1789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 
1354 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>