More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3125 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  59.11 
 
 
1827 aa  955    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  39.37 
 
 
1593 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  56.12 
 
 
1876 aa  884    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  56.69 
 
 
1823 aa  943    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  54.89 
 
 
1537 aa  1375    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.54 
 
 
2230 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  44.89 
 
 
2220 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  45.53 
 
 
2111 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
2551 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.61 
 
 
1587 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.9 
 
 
2232 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  66.34 
 
 
2188 aa  1174    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  31.27 
 
 
1559 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.27 
 
 
1559 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.09 
 
 
4165 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.18 
 
 
6768 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  62.69 
 
 
1520 aa  1634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  63.77 
 
 
1190 aa  1289    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  54.57 
 
 
1580 aa  1332    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  46.64 
 
 
2085 aa  683    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 
2880 aa  695    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  80.98 
 
 
1822 aa  2856    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  44.03 
 
 
2162 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 
3033 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.14 
 
 
3427 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.72 
 
 
4478 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
3092 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  62.69 
 
 
1520 aa  1634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  63.77 
 
 
1190 aa  1289    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  54.57 
 
 
1580 aa  1332    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  46.64 
 
 
2085 aa  683    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 
3696 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 
1955 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  57.75 
 
 
1805 aa  984    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1812 aa  3633    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  52.9 
 
 
1581 aa  1282    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  56.63 
 
 
1828 aa  939    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.43 
 
 
2136 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  43.34 
 
 
2225 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  36.3 
 
 
1584 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  44.01 
 
 
2890 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  52.77 
 
 
1577 aa  1272    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  63.68 
 
 
1190 aa  1286    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  54.48 
 
 
1580 aa  1314    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  46.42 
 
 
2085 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 
2762 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  55.97 
 
 
1806 aa  974    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  46.05 
 
 
2126 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  43.39 
 
 
2126 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
7110 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  44.38 
 
 
2108 aa  631  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  44.04 
 
 
3424 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  45.48 
 
 
2101 aa  632  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  42.6 
 
 
1263 aa  632  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  41.87 
 
 
2277 aa  631  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  42.75 
 
 
1601 aa  628  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  44.24 
 
 
3408 aa  629  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  42.51 
 
 
2108 aa  628  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  41.77 
 
 
3449 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.18 
 
 
1867 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  39.77 
 
 
1966 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.16 
 
 
1087 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  45.49 
 
 
2111 aa  622  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.62 
 
 
5255 aa  622  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 
3676 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  43.16 
 
 
2966 aa  623  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.72 
 
 
1909 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.16 
 
 
3930 aa  619  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  43.56 
 
 
3494 aa  619  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  36.42 
 
 
3281 aa  617  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  42.58 
 
 
7210 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.35 
 
 
1656 aa  616  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  34.78 
 
 
2081 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 
3693 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 
3693 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  43.64 
 
 
3670 aa  612  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  43.17 
 
 
3355 aa  612  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 
1704 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 
1354 aa  612  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 
1704 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.22 
 
 
3702 aa  613  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
1874 aa  608  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.62 
 
 
1144 aa  609  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  33.19 
 
 
3130 aa  610  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.04 
 
 
3176 aa  610  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.39 
 
 
1939 aa  608  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.16 
 
 
4111 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  35.81 
 
 
1548 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  42.78 
 
 
1704 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  43.47 
 
 
4080 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
1789 aa  601  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  40.99 
 
 
7279 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.54 
 
 
1349 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.82 
 
 
1822 aa  600  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.33 
 
 
1349 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.24 
 
 
3679 aa  599  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  39.71 
 
 
1114 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 
5154 aa  592  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  39.74 
 
 
2477 aa  593  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.16 
 
 
2333 aa  593  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>