More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3960 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 
1806 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 
1924 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  38.17 
 
 
2220 aa  1264    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 
3080 aa  1031    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  43.81 
 
 
2880 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  39.08 
 
 
2604 aa  1207    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  47.18 
 
 
2230 aa  1853    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.64 
 
 
5255 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  37.78 
 
 
2188 aa  1232    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  37.89 
 
 
2545 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.59 
 
 
3508 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.89 
 
 
1939 aa  985    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  46.14 
 
 
1822 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
3493 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  40.32 
 
 
3494 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
2556 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  36.63 
 
 
2101 aa  1085    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.03 
 
 
2719 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  45.47 
 
 
2333 aa  1040    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  38.19 
 
 
2546 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  36.99 
 
 
2499 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 
1559 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  45.88 
 
 
1584 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  38.27 
 
 
2111 aa  1189    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 
1831 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
2551 aa  789    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
1874 aa  1017    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.44 
 
 
1656 aa  832    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  47.4 
 
 
1144 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 
1587 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.62 
 
 
2126 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  38.11 
 
 
2546 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.77 
 
 
3158 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  37.93 
 
 
1602 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  38.98 
 
 
2545 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  39.29 
 
 
1827 aa  844    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  43 
 
 
3252 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  40.66 
 
 
2090 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 
3176 aa  1249    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  38.33 
 
 
2543 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  38.01 
 
 
3101 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  42.79 
 
 
1087 aa  791    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  37.09 
 
 
2486 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.13 
 
 
3111 aa  916    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  42.52 
 
 
4165 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  42.09 
 
 
1832 aa  940    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  39.19 
 
 
7210 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.69 
 
 
7279 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  42.76 
 
 
1537 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  38.06 
 
 
2544 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
3693 aa  1143    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  44.7 
 
 
1520 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 
1190 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  45.44 
 
 
1580 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  38.04 
 
 
2085 aa  1195    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 
1704 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  43.24 
 
 
1577 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 
2551 aa  788    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 
1909 aa  711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.44 
 
 
1354 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  41.25 
 
 
1789 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  41.57 
 
 
1823 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 
3645 aa  833    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  41.87 
 
 
3130 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 
4111 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.34 
 
 
4478 aa  700    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
2543 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  38.06 
 
 
2544 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2232 aa  4505    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
3693 aa  1143    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  44.7 
 
 
1520 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 
1190 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  45.44 
 
 
1580 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  38.04 
 
 
2085 aa  1195    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 
1704 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.08 
 
 
3676 aa  1136    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.57 
 
 
2477 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.58 
 
 
3696 aa  1111    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  36.37 
 
 
3711 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
1805 aa  805    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  43.6 
 
 
1812 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  44.52 
 
 
1581 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 
1828 aa  718    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  36.98 
 
 
2547 aa  685    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  37.6 
 
 
2126 aa  1148    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  38.27 
 
 
2546 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  36.69 
 
 
2108 aa  1093    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  38.27 
 
 
2546 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  38.11 
 
 
2546 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 
4930 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  40.56 
 
 
1876 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  38.27 
 
 
2546 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 
3702 aa  1153    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 
1190 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  45.28 
 
 
1580 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  38.04 
 
 
2085 aa  1192    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
1704 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 
5154 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.79 
 
 
4151 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  38.27 
 
 
2546 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>