More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3286 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 
1832 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.33 
 
 
1804 aa  714    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  42.41 
 
 
2499 aa  1624    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
2476 aa  1315    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.567588 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01036  polyketide synthase, putative (JCVI)  29.24 
 
 
2527 aa  710    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.756203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  37.04 
 
 
2492 aa  1297    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  99.73 
 
 
2546 aa  5030    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 
2543 aa  1655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.19 
 
 
1144 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  100 
 
 
2546 aa  5043    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  39.89 
 
 
2468 aa  1299    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  39.68 
 
 
2500 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  90.22 
 
 
2545 aa  4333    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  89.6 
 
 
2545 aa  4288    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
2468 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  40.36 
 
 
2486 aa  1530    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  69.96 
 
 
2543 aa  3268    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 
2460 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.94 
 
 
3111 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 
1939 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  89.4 
 
 
2544 aa  4285    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  40.36 
 
 
2486 aa  1530    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 
2230 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  42.93 
 
 
2485 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 
2551 aa  1040    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  40.62 
 
 
2507 aa  882    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 
2333 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  36.35 
 
 
2523 aa  1261    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  89.44 
 
 
2544 aa  4289    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  42.95 
 
 
2492 aa  779    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  59 
 
 
2556 aa  2699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
2232 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  39.97 
 
 
2547 aa  1660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 
2352 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.27 
 
 
3101 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  99.76 
 
 
2546 aa  5031    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  99.76 
 
 
2546 aa  5031    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  99.53 
 
 
2546 aa  5022    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 
2484 aa  1298    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  99.73 
 
 
2546 aa  5029    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  42.83 
 
 
2468 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  99.76 
 
 
2546 aa  5031    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.01 
 
 
1822 aa  637  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.44 
 
 
1909 aa  628  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.74 
 
 
2890 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
1874 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.91 
 
 
3449 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.41 
 
 
3693 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.41 
 
 
3693 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 
3702 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.07 
 
 
2225 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.96 
 
 
1587 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 
3176 aa  602  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  37.39 
 
 
2126 aa  598  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 
3676 aa  600  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  36.2 
 
 
1966 aa  596  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.52 
 
 
3679 aa  595  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.12 
 
 
2136 aa  593  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 
7110 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 
1656 aa  589  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  38.74 
 
 
3158 aa  586  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.54 
 
 
3930 aa  583  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  38.57 
 
 
4607 aa  583  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.15 
 
 
3696 aa  582  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  35.87 
 
 
2220 aa  580  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 
3080 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  34.99 
 
 
4183 aa  576  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
3874 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.84 
 
 
4151 aa  576  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.05 
 
 
3645 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.85 
 
 
1087 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.63 
 
 
1867 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 
7210 aa  573  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 
5255 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  37.34 
 
 
1831 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.31 
 
 
2462 aa  569  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.67 
 
 
3508 aa  570  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  41.2 
 
 
1580 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  37.04 
 
 
2846 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 
1354 aa  566  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  41.2 
 
 
1580 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 
5154 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  34.92 
 
 
2719 aa  563  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.49 
 
 
1349 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  37.89 
 
 
2090 aa  563  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  35.95 
 
 
7279 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  36.47 
 
 
2604 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.94 
 
 
1789 aa  563  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  40.44 
 
 
1581 aa  562  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.05 
 
 
2880 aa  562  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  40.33 
 
 
2162 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
2551 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  40.71 
 
 
1584 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  36.28 
 
 
2966 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.4 
 
 
1349 aa  560  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  36.88 
 
 
4080 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  35.49 
 
 
1827 aa  556  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.57 
 
 
1828 aa  556  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 
1580 aa  556  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 
3493 aa  556  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>