More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2617 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  39.27 
 
 		 2476 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 		 2547 aa  1980    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  100 
 
 		 2486 aa  5017    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  43 
 
 		 2545 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 		 2230 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  42.92 
 
 		 2546 aa  847    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  45.6 
 
 		 2499 aa  1909    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  39.48 
 
 		 2507 aa  804    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  42.85 
 
 		 2546 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 		 2545 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 		 2492 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  37.99 
 
 		 2468 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  49.08 
 
 		 2543 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  37.48 
 
 		 2485 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  35.06 
 
 		 3111 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.09 
 
 		 2232 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 		 2492 aa  703    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  43.03 
 
 		 2544 aa  849    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.91 
 
 		 1804 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2486 aa  5017    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.95 
 
 		 1939 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  43.03 
 
 		 2544 aa  849    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  38.44 
 
 		 2468 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.31 
 
 		 1832 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.05 
 
 		 2333 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  42.85 
 
 		 2546 aa  847    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  42.85 
 
 		 2546 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  42.77 
 
 		 2546 aa  847    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  45.26 
 
 		 2543 aa  1919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  42.85 
 
 		 2546 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  38.47 
 
 		 2484 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 		 2556 aa  824    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.89 
 
 		 3101 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  38.07 
 
 		 2468 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  42.85 
 
 		 2546 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 2500 aa  627  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  36.17 
 
 		 2460 aa  612  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.59 
 
 		 1144 aa  607  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.59 
 
 		 2551 aa  605  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.29 
 
 		 2225 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.62 
 
 		 2890 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.4 
 
 		 1867 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  35.19 
 
 		 1966 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.87 
 
 		 2136 aa  592  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 7110 aa  593  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 3176 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.99 
 
 		 3930 aa  590  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 		 5255 aa  587  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  32.66 
 
 		 2462 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 		 1656 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  37 
 
 		 2126 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  34.12 
 
 		 2523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 		 1805 aa  572  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  33.93 
 
 		 2277 aa  569  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  36.58 
 
 		 3494 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  36.84 
 
 		 4151 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 7210 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.26 
 
 		 1827 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  36.01 
 
 		 3158 aa  562  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.75 
 
 		 1822 aa  563  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 1874 aa  560  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  33.73 
 
 		 2220 aa  556  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  33.75 
 
 		 2108 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  37.66 
 
 		 2352 aa  556  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.2 
 
 		 1828 aa  555  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  39.65 
 
 		 1823 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  34.2 
 
 		 4183 aa  551  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 1831 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.12 
 
 		 2090 aa  553  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.01 
 
 		 1349 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.88 
 
 		 1349 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 		 4930 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.84 
 
 		 3508 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.14 
 
 		 1909 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.57 
 
 		 3449 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  40.72 
 
 		 1581 aa  548  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 		 7279 aa  545  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 		 1559 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 		 3645 aa  546  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  42.45 
 
 		 1580 aa  547  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  35.85 
 
 		 1789 aa  546  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 		 5400 aa  546  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 3493 aa  545  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  42.45 
 
 		 1580 aa  547  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.21 
 
 		 2085 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.21 
 
 		 2085 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.23 
 
 		 1087 aa  542  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  36.81 
 
 		 2846 aa  543  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  35.96 
 
 		 3080 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  34.44 
 
 		 2719 aa  539  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 1587 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.41 
 
 		 1559 aa  540  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 		 1806 aa  540  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  41.62 
 
 		 1580 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  37.28 
 
 		 1263 aa  537  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.02 
 
 		 1337 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  36.16 
 
 		 2966 aa  535  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  35.79 
 
 		 3408 aa  536  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.51 
 
 		 1816 aa  537  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 5154 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>