More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1146 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  37.38 
 
 		 2460 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  42.24 
 
 		 2543 aa  1692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 		 2484 aa  799    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 		 2468 aa  1305    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01036  polyketide synthase, putative (JCVI)  27.6 
 
 		 2527 aa  694    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.756203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 		 2230 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.15 
 
 		 2232 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  59.37 
 
 		 2546 aa  2676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  58.95 
 
 		 2545 aa  2674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  39.92 
 
 		 2352 aa  688    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 		 2547 aa  1689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 		 1144 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.86 
 
 		 2333 aa  741    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  59.07 
 
 		 2546 aa  2670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  43.28 
 
 		 2507 aa  925    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 2500 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  58.84 
 
 		 2545 aa  2696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  41.53 
 
 		 2486 aa  872    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  59.99 
 
 		 2543 aa  2762    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  41.46 
 
 		 2499 aa  1645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  35.83 
 
 		 3111 aa  683    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.18 
 
 		 1832 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  59.5 
 
 		 2544 aa  2684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  41.53 
 
 		 2486 aa  872    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2556 aa  5158    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.69 
 
 		 2551 aa  1045    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  39.19 
 
 		 3101 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  39.99 
 
 		 2492 aa  830    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  59.54 
 
 		 2544 aa  2688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.79 
 
 		 1804 aa  715    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  36.42 
 
 		 2492 aa  791    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  36.94 
 
 		 2523 aa  1327    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 		 2468 aa  1313    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 		 2485 aa  1348    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.23 
 
 		 1939 aa  710    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  59.41 
 
 		 2546 aa  2675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  59.41 
 
 		 2546 aa  2675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  59.41 
 
 		 2546 aa  2675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  59.29 
 
 		 2546 aa  2668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  38.62 
 
 		 2476 aa  802    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  59.15 
 
 		 2546 aa  2670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  38.52 
 
 		 2468 aa  1314    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.13 
 
 		 2890 aa  629  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.97 
 
 		 1822 aa  629  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.14 
 
 		 3930 aa  629  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 1874 aa  626  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.43 
 
 		 1909 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.26 
 
 		 7210 aa  611  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.33 
 
 		 1867 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36 
 
 		 3449 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  35.41 
 
 		 2220 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.44 
 
 		 3696 aa  599  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 7110 aa  595  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.58 
 
 		 2225 aa  596  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.04 
 
 		 2126 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.51 
 
 		 4151 aa  597  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 		 3676 aa  591  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  35 
 
 		 3080 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 3679 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 		 1587 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 		 3702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.42 
 
 		 1656 aa  583  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  34.74 
 
 		 2966 aa  582  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.25 
 
 		 3508 aa  583  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 		 3693 aa  583  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.85 
 
 		 2090 aa  582  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.2 
 
 		 3693 aa  583  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.94 
 
 		 1349 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  35.46 
 
 		 1966 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.76 
 
 		 1349 aa  579  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 5154 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.06 
 
 		 2136 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 		 3176 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.44 
 
 		 1835 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  36.19 
 
 		 3158 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 		 2880 aa  577  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 		 1581 aa  572  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.45 
 
 		 3494 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 		 1580 aa  569  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.63 
 
 		 2085 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  35.11 
 
 		 1806 aa  570  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 5255 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 		 1580 aa  569  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.63 
 
 		 2085 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  41.42 
 
 		 2846 aa  567  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 		 1789 aa  567  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  35.7 
 
 		 2085 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  36.35 
 
 		 4607 aa  562  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.98 
 
 		 4183 aa  563  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 3874 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  40.13 
 
 		 1577 aa  563  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 		 1805 aa  562  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  35.04 
 
 		 2108 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 		 2551 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  38.45 
 
 		 1114 aa  559  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  39.84 
 
 		 2477 aa  558  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  38.81 
 
 		 2020 aa  559  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.96 
 
 		 1087 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  33.31 
 
 		 2719 aa  556  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  34.2 
 
 		 2126 aa  555  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>