More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2407 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.3 
 
 
3508 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 
3711 aa  678    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.65 
 
 
2890 aa  922    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 
2545 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.42 
 
 
2225 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  36.6 
 
 
2499 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  37.68 
 
 
2220 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.16 
 
 
4183 aa  723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 
1832 aa  989    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  38.75 
 
 
7712 aa  735    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  38.64 
 
 
2546 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  38.64 
 
 
2546 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 
5255 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.01 
 
 
2232 aa  895    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.52 
 
 
1804 aa  1326    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
2551 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
1874 aa  894    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  34.48 
 
 
1966 aa  864    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 
1656 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.32 
 
 
7210 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  43.84 
 
 
1144 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 
1587 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  38.73 
 
 
2546 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  33.32 
 
 
2439 aa  759    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  38.69 
 
 
2543 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.77 
 
 
3695 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.9 
 
 
3494 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  36.89 
 
 
2486 aa  695    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 
2545 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.74 
 
 
1909 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.31 
 
 
1349 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  39.23 
 
 
2543 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  55.92 
 
 
3111 aa  3543    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.02 
 
 
2462 aa  853    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  36.89 
 
 
2486 aa  695    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 
2544 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  38.92 
 
 
2556 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 
1939 aa  1017    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  32.79 
 
 
4882 aa  1080    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
3101 aa  6242    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.99 
 
 
2551 aa  718    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  31.04 
 
 
1909 aa  795    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  37.03 
 
 
2507 aa  676    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  35.89 
 
 
2997 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.79 
 
 
2230 aa  841    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.67 
 
 
3449 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  39.04 
 
 
1126 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 
2544 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  33.92 
 
 
3645 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.89 
 
 
2136 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  36.55 
 
 
2108 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.3 
 
 
3176 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.4 
 
 
1822 aa  860    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.71 
 
 
1867 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
7110 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.45 
 
 
2604 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  38.64 
 
 
2546 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  38.64 
 
 
2546 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 
2547 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  38.56 
 
 
2546 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.51 
 
 
1789 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  38.81 
 
 
2546 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.91 
 
 
2090 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  37.36 
 
 
3930 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.1 
 
 
2333 aa  841    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
1816 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  38.69 
 
 
1831 aa  636  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.38 
 
 
1349 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.86 
 
 
2126 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  38.96 
 
 
3158 aa  633  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  41.31 
 
 
3424 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  28.66 
 
 
2508 aa  630  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  36.04 
 
 
4151 aa  628  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.51 
 
 
3086 aa  627  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.47 
 
 
1087 aa  626  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.51 
 
 
3086 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  32.95 
 
 
3080 aa  625  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.13 
 
 
3291 aa  621  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.56 
 
 
2108 aa  623  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.88 
 
 
9498 aa  623  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  34.01 
 
 
2101 aa  622  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  32.89 
 
 
2126 aa  619  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.14 
 
 
2791 aa  619  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.3 
 
 
2085 aa  620  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.3 
 
 
2085 aa  620  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.3 
 
 
2085 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  37.36 
 
 
6768 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  35.55 
 
 
2277 aa  617  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.37 
 
 
2370 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  38.28 
 
 
1805 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.68 
 
 
1372 aa  613  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.47 
 
 
2719 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
5400 aa  612  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.34 
 
 
3696 aa  613  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 
3679 aa  610  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.35 
 
 
1337 aa  610  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  36.65 
 
 
2111 aa  610  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  37.84 
 
 
4080 aa  607  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.37 
 
 
3676 aa  607  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.04 
 
 
3308 aa  602  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>