More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2878 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  45.88 
 
 
2101 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.55 
 
 
1909 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  57.4 
 
 
1823 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.61 
 
 
2230 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  52.47 
 
 
1577 aa  963    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
2551 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
1656 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.97 
 
 
1587 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  43.3 
 
 
2225 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  50.92 
 
 
1537 aa  983    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  43.64 
 
 
2232 aa  685    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  70.62 
 
 
1520 aa  1562    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1190 aa  2370    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  59.71 
 
 
1580 aa  1083    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  46.31 
 
 
2085 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  56.05 
 
 
1876 aa  869    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  44.49 
 
 
2890 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  64.56 
 
 
2188 aa  1118    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  46.75 
 
 
2220 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  45.41 
 
 
2162 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  57.75 
 
 
1827 aa  946    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.06 
 
 
2136 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  70.62 
 
 
1520 aa  1562    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1190 aa  2370    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  59.71 
 
 
1580 aa  1083    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  46.31 
 
 
2085 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  54.19 
 
 
1805 aa  933    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  63.49 
 
 
1812 aa  1276    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  53.91 
 
 
1581 aa  1004    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  59.14 
 
 
1828 aa  986    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  46.81 
 
 
2126 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  44.11 
 
 
2108 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  63.65 
 
 
1822 aa  1265    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  47.17 
 
 
2111 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  99.41 
 
 
1190 aa  2360    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  59.52 
 
 
1580 aa  1064    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  46.18 
 
 
2085 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  53.87 
 
 
1806 aa  911    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.62 
 
 
2126 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  46.26 
 
 
4478 aa  632  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.7 
 
 
1867 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
1874 aa  622  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.3 
 
 
3449 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  45.73 
 
 
2111 aa  619  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  43.98 
 
 
3424 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.78 
 
 
1559 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  38.9 
 
 
1559 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  44.24 
 
 
3408 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 
2333 aa  618  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.52 
 
 
1087 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.98 
 
 
3930 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 
7110 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  44.05 
 
 
3670 aa  615  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  44.58 
 
 
1076 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.41 
 
 
3176 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  43.33 
 
 
2966 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  43.31 
 
 
2108 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  44.95 
 
 
1263 aa  612  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  41.62 
 
 
4111 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  47.52 
 
 
1819 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.65 
 
 
1144 aa  608  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 
1354 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  43.03 
 
 
7279 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  44.27 
 
 
4151 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  42.41 
 
 
7210 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 
5154 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 
1939 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  43.33 
 
 
3676 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.64 
 
 
1804 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.9 
 
 
3494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  45.77 
 
 
3427 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  41.45 
 
 
2277 aa  601  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  44.76 
 
 
5255 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.42 
 
 
1372 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.42 
 
 
3696 aa  595  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.53 
 
 
2719 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  43.22 
 
 
3355 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  41.25 
 
 
1789 aa  591  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 
3693 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
1704 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 
3693 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 
1704 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 
3702 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  40.98 
 
 
1601 aa  589  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  44.43 
 
 
3254 aa  588  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.64 
 
 
1349 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  40.98 
 
 
1114 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.76 
 
 
1349 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  43.92 
 
 
6768 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 
1832 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  42.12 
 
 
3033 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.84 
 
 
1822 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.37 
 
 
3493 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  43.25 
 
 
1593 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  42.4 
 
 
1704 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 
3679 aa  586  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  41.35 
 
 
1831 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  41.12 
 
 
3508 aa  582  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  43.36 
 
 
4080 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  43.15 
 
 
1744 aa  582  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>