More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3889 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  47.47 
 
 
3033 aa  1801    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  46.77 
 
 
2376 aa  782    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.78 
 
 
3874 aa  1362    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  42.62 
 
 
1602 aa  891    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.4 
 
 
1909 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.44 
 
 
1955 aa  991    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  35.66 
 
 
1577 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  47.01 
 
 
3355 aa  1180    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  43.89 
 
 
4930 aa  1305    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  46.49 
 
 
1548 aa  1072    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39.85 
 
 
2719 aa  983    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.69 
 
 
2066 aa  1072    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  32.68 
 
 
1559 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  47.25 
 
 
3508 aa  1456    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  43.89 
 
 
4151 aa  1130    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 
1832 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  42.58 
 
 
2847 aa  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
3092 aa  1833    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
2551 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
1874 aa  821    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37 
 
 
1656 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.15 
 
 
1822 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.23 
 
 
1587 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  42.09 
 
 
4111 aa  1060    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.16 
 
 
2966 aa  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.57 
 
 
1071 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
1816 aa  1258    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.44 
 
 
4183 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.93 
 
 
1939 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  45.43 
 
 
3494 aa  1486    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 
3130 aa  931    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.58 
 
 
2333 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.5 
 
 
2126 aa  1102    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  44.68 
 
 
2846 aa  1205    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  41.86 
 
 
2081 aa  979    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.85 
 
 
4575 aa  952    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.87 
 
 
3148 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  42.58 
 
 
2060 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  48 
 
 
1831 aa  1312    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.3 
 
 
1537 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.32 
 
 
4080 aa  1281    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 
3693 aa  1479    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 
1520 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.44 
 
 
1559 aa  811    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.36 
 
 
2762 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  43.33 
 
 
2020 aa  918    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  47.53 
 
 
7210 aa  1650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.05 
 
 
2230 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.78 
 
 
3158 aa  2133    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53.17 
 
 
1593 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
7110 aa  1587    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.76 
 
 
3930 aa  1543    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.54 
 
 
2090 aa  1330    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.74 
 
 
1867 aa  1398    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  46.94 
 
 
5154 aa  1330    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  43.93 
 
 
4840 aa  1355    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 
1924 aa  1116    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  52.96 
 
 
1143 aa  851    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.37 
 
 
2024 aa  928    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.45 
 
 
4478 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  48.11 
 
 
1584 aa  1231    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.38 
 
 
1820 aa  1211    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  44.79 
 
 
3711 aa  1384    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 
3693 aa  1479    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 
1520 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
1837 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  41.77 
 
 
3424 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.72 
 
 
2136 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  47.15 
 
 
7279 aa  1725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  46.84 
 
 
2374 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.55 
 
 
5400 aa  1408    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 
3676 aa  1412    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  48.31 
 
 
3408 aa  1256    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.69 
 
 
4882 aa  1342    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  48.84 
 
 
1789 aa  1361    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 
1805 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  44.96 
 
 
3449 aa  2430    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  44.74 
 
 
2113 aa  1086    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  31.35 
 
 
3093 aa  806    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 
2367 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  45.82 
 
 
5255 aa  1503    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.2 
 
 
3176 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 
3645 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 
2880 aa  762    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.25 
 
 
3254 aa  1872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  42.29 
 
 
3670 aa  1136    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 
3702 aa  1474    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.8 
 
 
3427 aa  695    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
2232 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.56 
 
 
2890 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.06 
 
 
3463 aa  1307    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.99 
 
 
6768 aa  1193    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  44.89 
 
 
2277 aa  1292    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
3493 aa  6661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  30.47 
 
 
2462 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 
3679 aa  1405    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  47.34 
 
 
1601 aa  1186    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.1 
 
 
3101 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  44.66 
 
 
2107 aa  1060    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.09 
 
 
4607 aa  969    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>