More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12948 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  60.32 
 
 
1822 aa  973    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  45.87 
 
 
2111 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.21 
 
 
3930 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  40.03 
 
 
2126 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.65 
 
 
7279 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.62 
 
 
1909 aa  866    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.64 
 
 
1349 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  45.24 
 
 
3424 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.42 
 
 
3176 aa  703    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.19 
 
 
3508 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.74 
 
 
2333 aa  725    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  41.46 
 
 
2220 aa  908    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  38.22 
 
 
2719 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.64 
 
 
1349 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.57 
 
 
7210 aa  759    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.13 
 
 
4151 aa  675    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  47.88 
 
 
2188 aa  1125    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.35 
 
 
2232 aa  866    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
2551 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.42 
 
 
1874 aa  880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.72 
 
 
1656 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.49 
 
 
2090 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.64 
 
 
1587 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  41.68 
 
 
2162 aa  1084    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.29 
 
 
1822 aa  853    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.74 
 
 
2230 aa  830    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  40.79 
 
 
3355 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
5400 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.09 
 
 
1372 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  33.89 
 
 
3449 aa  759    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.24 
 
 
1939 aa  896    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  45.7 
 
 
1076 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.72 
 
 
2966 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.7 
 
 
3111 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.19 
 
 
3645 aa  757    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 
5255 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
3874 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.95 
 
 
2136 aa  734    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.69 
 
 
1867 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.48 
 
 
1087 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.03 
 
 
3693 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  34.21 
 
 
1966 aa  884    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  57.36 
 
 
1520 aa  950    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  57.75 
 
 
1190 aa  958    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  57.44 
 
 
1580 aa  931    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  40.2 
 
 
2085 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  43.43 
 
 
1704 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  100 
 
 
1827 aa  3657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.61 
 
 
2551 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.01 
 
 
1909 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  33.57 
 
 
4882 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  53.73 
 
 
1823 aa  962    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  45.36 
 
 
1819 aa  661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
1816 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  40.18 
 
 
2108 aa  846    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.69 
 
 
1804 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.51 
 
 
3494 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.97 
 
 
1832 aa  871    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  63.79 
 
 
1537 aa  1098    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  36.09 
 
 
2890 aa  862    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  39.74 
 
 
2111 aa  831    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.03 
 
 
3693 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.76 
 
 
2126 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  57.36 
 
 
1520 aa  950    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  57.75 
 
 
1190 aa  958    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  57.44 
 
 
1580 aa  931    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  40.2 
 
 
2085 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  43.43 
 
 
1704 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 
3676 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  36.79 
 
 
3408 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 
1263 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  58.8 
 
 
1805 aa  1973    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  59.31 
 
 
1812 aa  968    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  55.68 
 
 
1581 aa  921    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  51.15 
 
 
1828 aa  956    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  42.11 
 
 
1744 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
7110 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  40.59 
 
 
3670 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.55 
 
 
2462 aa  724    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  34.59 
 
 
3711 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  53.66 
 
 
1577 aa  878    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.91 
 
 
2225 aa  805    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.05 
 
 
3702 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  38.9 
 
 
2101 aa  813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  57.98 
 
 
1190 aa  959    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  57.44 
 
 
1580 aa  912    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  40.13 
 
 
2085 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 
1704 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  56.92 
 
 
1806 aa  1896    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.48 
 
 
1789 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
3679 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  43.21 
 
 
1698 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.85 
 
 
4183 aa  717    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 
1559 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 
4111 aa  635  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  42.76 
 
 
1832 aa  632  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  37.07 
 
 
3463 aa  632  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  40.27 
 
 
4575 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.29 
 
 
1559 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.15 
 
 
4478 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>