More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3611 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1832 aa  3533    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.95 
 
 
2230 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  42.76 
 
 
1827 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  38.01 
 
 
1823 aa  947    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  45.23 
 
 
1698 aa  1206    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  40.47 
 
 
2220 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  33.35 
 
 
2277 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  44.94 
 
 
2162 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 
1580 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  45.36 
 
 
1704 aa  1219    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  41.78 
 
 
1835 aa  1125    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 
1580 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  45.36 
 
 
1704 aa  1219    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  40.8 
 
 
1805 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  43.89 
 
 
1581 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.31 
 
 
1828 aa  954    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 
1744 aa  1174    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  42.8 
 
 
1577 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  43.89 
 
 
1580 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  44.99 
 
 
1704 aa  1206    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  37.68 
 
 
1876 aa  963    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  48.84 
 
 
1263 aa  949    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.29 
 
 
3930 aa  633  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.08 
 
 
2333 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  42.86 
 
 
2111 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 
2232 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.88 
 
 
1939 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 
1806 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  42.16 
 
 
1537 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.94 
 
 
1867 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.17 
 
 
2890 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.05 
 
 
1656 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  40.18 
 
 
3494 aa  613  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  40.43 
 
 
3101 aa  612  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.74 
 
 
3111 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  41.95 
 
 
4607 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  41.39 
 
 
1520 aa  606  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.78 
 
 
2085 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  41.28 
 
 
3449 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  41.39 
 
 
1520 aa  606  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.78 
 
 
2085 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.78 
 
 
2085 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  42.11 
 
 
2090 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  41.42 
 
 
1114 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.1 
 
 
3645 aa  599  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.82 
 
 
3508 aa  599  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 
1812 aa  600  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.83 
 
 
1909 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  40.5 
 
 
2966 aa  597  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  39.3 
 
 
2188 aa  596  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
7110 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.81 
 
 
1804 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  41.79 
 
 
1822 aa  592  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  41.01 
 
 
1190 aa  593  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  41.01 
 
 
1190 aa  593  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 
1190 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  39.34 
 
 
3408 aa  589  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 
7279 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 
1789 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.05 
 
 
1144 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  38.98 
 
 
2108 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  37.9 
 
 
2108 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  39.78 
 
 
2101 aa  582  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  39.72 
 
 
2126 aa  581  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.09 
 
 
2126 aa  583  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.84 
 
 
2719 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.75 
 
 
2136 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 
5154 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  38.76 
 
 
7210 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 
3493 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  39.75 
 
 
1832 aa  572  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  39.79 
 
 
4930 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.27 
 
 
2225 aa  573  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.45 
 
 
3254 aa  568  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  39.11 
 
 
2111 aa  569  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  39.47 
 
 
3355 aa  570  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  42.42 
 
 
6768 aa  570  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.23 
 
 
5255 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  39.33 
 
 
2020 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.94 
 
 
4151 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  41.63 
 
 
1584 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.47 
 
 
1305 aa  562  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 
3693 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 
3693 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 
3702 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  38.36 
 
 
1831 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.35 
 
 
2551 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 
1587 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  41.43 
 
 
1601 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  39.85 
 
 
2846 aa  555  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
3874 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.38 
 
 
1822 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  40.94 
 
 
1076 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  40.16 
 
 
4080 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
1874 aa  550  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.67 
 
 
3158 aa  549  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
5400 aa  546  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  39.06 
 
 
1820 aa  545  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 
1354 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 
3676 aa  545  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>