More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3477 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.84 
 
 		 7210 aa  1289    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  39.19 
 
 		 2090 aa  900    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.83 
 
 		 1867 aa  1008    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  39.32 
 
 		 1573 aa  780    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  44.11 
 
 		 1584 aa  956    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.16 
 
 		 4151 aa  988    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.33 
 
 		 1939 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  40.32 
 
 		 3158 aa  1523    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  39.86 
 
 		 1548 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  41.01 
 
 		 2367 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 		 7110 aa  1292    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.63 
 
 		 2719 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  38.6 
 
 		 2066 aa  923    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.66 
 
 		 3176 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  39.22 
 
 		 3494 aa  1076    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  44.74 
 
 		 3254 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 		 3493 aa  1783    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  38.65 
 
 		 5255 aa  1060    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.78 
 
 		 1816 aa  1043    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.76 
 
 		 2551 aa  948    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 1874 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  47.56 
 
 		 2108 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.74 
 
 		 1126 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.29 
 
 		 2078 aa  923    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  48.07 
 
 		 1143 aa  746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 3092 aa  1602    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.18 
 
 		 4264 aa  866    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 5400 aa  1229    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  38.58 
 
 		 1924 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.85 
 
 		 2762 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 3874 aa  965    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.56 
 
 		 2880 aa  696    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 		 1955 aa  849    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 		 2081 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  38.37 
 
 		 3930 aa  1135    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  39.3 
 
 		 2277 aa  957    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  36.59 
 
 		 3508 aa  988    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.02 
 
 		 1559 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  49.51 
 
 		 2126 aa  812    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  41.07 
 
 		 2113 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 3693 aa  1342    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  43.93 
 
 		 2376 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.95 
 
 		 3427 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  35.91 
 
 		 1580 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.23 
 
 		 1305 aa  733    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  39.5 
 
 		 4575 aa  949    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.19 
 
 		 1101 aa  716    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  40.12 
 
 		 4882 aa  1246    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  30.2 
 
 		 1559 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  100 
 
 		 3281 aa  6415    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.47 
 
 		 3449 aa  1858    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  44.33 
 
 		 2374 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  43.81 
 
 		 7279 aa  1540    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  36.22 
 
 		 4930 aa  944    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  48.92 
 
 		 4111 aa  759    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 5154 aa  963    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  40.06 
 
 		 4840 aa  1151    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.44 
 
 		 4478 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  49.22 
 
 		 2020 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.69 
 
 		 3711 aa  1179    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 3693 aa  1342    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  41.51 
 
 		 3463 aa  1187    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  42.86 
 
 		 4080 aa  1125    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  35.91 
 
 		 1580 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  39.77 
 
 		 1820 aa  924    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  44.76 
 
 		 1593 aa  968    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.71 
 
 		 3676 aa  1326    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 1837 aa  881    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.03 
 
 		 3696 aa  1277    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  39.64 
 
 		 3408 aa  885    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  38.98 
 
 		 2846 aa  926    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 		 2060 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  42.98 
 
 		 1077 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  44.63 
 
 		 6768 aa  968    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.59 
 
 		 2966 aa  797    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  40.17 
 
 		 2107 aa  888    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  33.7 
 
 		 3130 aa  1029    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  42.31 
 
 		 1601 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  32.45 
 
 		 4646 aa  800    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 		 3108 aa  865    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  42.7 
 
 		 3033 aa  1499    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  38.63 
 
 		 1602 aa  758    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 		 3093 aa  877    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.19 
 
 		 3702 aa  1332    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.48 
 
 		 2232 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  45.45 
 
 		 1114 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 		 1580 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  39.6 
 
 		 3670 aa  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  49.29 
 
 		 3355 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.55 
 
 		 3099 aa  768    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 1831 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 		 3645 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.81 
 
 		 3679 aa  1296    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  49.57 
 
 		 1789 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  43.12 
 
 		 3148 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  48.21 
 
 		 4607 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  37.72 
 
 		 1822 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  45.47 
 
 		 1071 aa  637  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.81 
 
 		 2230 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 		 1520 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>