More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3151 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.93 
 
 
3711 aa  1182    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  46.69 
 
 
1831 aa  1029    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  67.81 
 
 
1548 aa  1182    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  55.9 
 
 
3033 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  43.33 
 
 
3045 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 
2232 aa  962    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.24 
 
 
2126 aa  1480    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
3874 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  47.11 
 
 
1616 aa  1164    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45.54 
 
 
1402 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  48.07 
 
 
5255 aa  1019    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.18 
 
 
3176 aa  1076    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  49.64 
 
 
7279 aa  1088    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.73 
 
 
2719 aa  1468    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.9 
 
 
2066 aa  929    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.24 
 
 
1337 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  50.6 
 
 
1584 aa  792    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  48.09 
 
 
6768 aa  1521    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  30.78 
 
 
3080 aa  702    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.92 
 
 
4183 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.81 
 
 
2551 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
1874 aa  810    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 
1656 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.29 
 
 
1837 aa  998    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.3 
 
 
1587 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  43.38 
 
 
3493 aa  890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.92 
 
 
1349 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2367 aa  4642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.29 
 
 
2604 aa  943    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  40.95 
 
 
2762 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  48.18 
 
 
3508 aa  1112    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.48 
 
 
4607 aa  1371    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.42 
 
 
1087 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  49.84 
 
 
2024 aa  763    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.34 
 
 
4080 aa  1182    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  48.09 
 
 
3408 aa  1066    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  33.98 
 
 
2101 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  52.33 
 
 
2081 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.94 
 
 
2847 aa  1013    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.7 
 
 
7110 aa  1270    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  48.93 
 
 
3400 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  53.74 
 
 
3148 aa  822    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  44.81 
 
 
1820 aa  964    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.31 
 
 
2462 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
3693 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  61.44 
 
 
2060 aa  2050    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  45.25 
 
 
3355 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.68 
 
 
5400 aa  1234    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.39 
 
 
2107 aa  916    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.92 
 
 
2085 aa  875    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  50.91 
 
 
4840 aa  1112    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  53.48 
 
 
2376 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.88 
 
 
2551 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  44.1 
 
 
2090 aa  948    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
1354 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.66 
 
 
7210 aa  1288    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  45.7 
 
 
4575 aa  1299    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 
1924 aa  919    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  35.6 
 
 
2220 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.41 
 
 
3158 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  47.31 
 
 
4478 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.27 
 
 
1816 aa  1287    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  33.72 
 
 
2188 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
3693 aa  761    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  51.42 
 
 
1602 aa  1338    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.86 
 
 
1593 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  51.05 
 
 
1601 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.36 
 
 
3494 aa  1164    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.92 
 
 
2085 aa  875    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  51.27 
 
 
1071 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  42.27 
 
 
3676 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.96 
 
 
1372 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.45 
 
 
3696 aa  716    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  50.06 
 
 
4111 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.67 
 
 
1805 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  35.54 
 
 
5526 aa  688    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  54.35 
 
 
2374 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  41.11 
 
 
1559 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  47.1 
 
 
1789 aa  1022    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  46.97 
 
 
3670 aa  1028    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  34.47 
 
 
2108 aa  864    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  50.87 
 
 
3463 aa  1165    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 
1939 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.25 
 
 
2230 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  50.46 
 
 
2113 aa  1129    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  48.21 
 
 
1143 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.15 
 
 
3645 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.87 
 
 
3702 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  49.48 
 
 
4151 aa  1739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
3092 aa  967    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.51 
 
 
4930 aa  919    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.86 
 
 
2085 aa  874    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  43.83 
 
 
2846 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  34.64 
 
 
2126 aa  860    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.87 
 
 
1349 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  54.49 
 
 
1955 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.85 
 
 
2966 aa  1025    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.36 
 
 
3679 aa  1062    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.39 
 
 
5154 aa  962    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  58.59 
 
 
3254 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>