More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3479 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  49.18 
 
 
1584 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  49.46 
 
 
3670 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  48.18 
 
 
4151 aa  745    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  46.35 
 
 
3254 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  47.03 
 
 
5255 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.57 
 
 
2719 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  46.9 
 
 
1593 aa  673    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  47.93 
 
 
2126 aa  738    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  48.06 
 
 
3494 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.61 
 
 
4930 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  46.66 
 
 
3493 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  50.11 
 
 
1601 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.74 
 
 
7210 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  43.44 
 
 
1143 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.95 
 
 
3508 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
5400 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  47.24 
 
 
3158 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.53 
 
 
1820 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.27 
 
 
3930 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.71 
 
 
1789 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.27 
 
 
4111 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 
5154 aa  703    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  50.4 
 
 
4575 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  43.32 
 
 
3281 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.39 
 
 
4607 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.55 
 
 
3874 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  47.05 
 
 
1831 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  46.74 
 
 
1573 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  43.49 
 
 
1114 aa  678    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  100 
 
 
1077 aa  2126    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  47.45 
 
 
2020 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.84 
 
 
3408 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  46.89 
 
 
2277 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  48.38 
 
 
2846 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.14 
 
 
1101 aa  679    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  44.76 
 
 
3449 aa  697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  50.28 
 
 
7279 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.95 
 
 
6768 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.84 
 
 
1867 aa  714    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  44.87 
 
 
2090 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
7110 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  48.62 
 
 
2966 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.52 
 
 
3355 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.87 
 
 
1305 aa  705    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  46.94 
 
 
2108 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  40.84 
 
 
2066 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 
1924 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.47 
 
 
4080 aa  628  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 
3711 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  43.61 
 
 
1602 aa  621  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.9 
 
 
4264 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
1816 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  43.51 
 
 
3463 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  43.9 
 
 
1548 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.27 
 
 
1126 aa  612  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  44.38 
 
 
2113 aa  608  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  41.5 
 
 
1071 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
3092 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  43.56 
 
 
3033 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.3 
 
 
1955 aa  598  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  41.62 
 
 
2376 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 
2081 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
2374 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  44.56 
 
 
3148 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
2367 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  44.37 
 
 
4840 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  38.74 
 
 
2666 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.66 
 
 
2230 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.36 
 
 
2890 aa  571  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.53 
 
 
2024 aa  569  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.25 
 
 
1087 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.47 
 
 
2136 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  43.86 
 
 
2060 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 
1580 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  42.74 
 
 
2107 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  40.64 
 
 
1580 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.86 
 
 
1822 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  40.69 
 
 
4183 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  40.8 
 
 
4882 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
1837 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  37.61 
 
 
1402 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.39 
 
 
2551 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  40.33 
 
 
1580 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  38.87 
 
 
2225 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.51 
 
 
1144 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  40.74 
 
 
3424 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
3693 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
3693 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  37.22 
 
 
2477 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 
1805 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.44 
 
 
1349 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.69 
 
 
2078 aa  538  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  40.59 
 
 
1827 aa  539  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.23 
 
 
3702 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  40 
 
 
1876 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  40.43 
 
 
2220 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
1874 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.37 
 
 
1349 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 
1559 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  40.11 
 
 
2085 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>