More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0175 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  37.19 
 
 		 1876 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  39.75 
 
 		 2111 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5010  mycolic acid condensase  47.4 
 
 		 1850 aa  1038    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  55.55 
 
 		 1759 aa  1910    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5098  mycolic acid condensase  47.4 
 
 		 1850 aa  1038    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13834  polyketide synthase pks13  49.94 
 
 		 1733 aa  1653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.924162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 1581 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  37.9 
 
 		 1828 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  47.1 
 
 		 1840 aa  1009    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1704 aa  3457    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  39.91 
 
 		 2162 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5391  mycolic acid condensase  49.16 
 
 		 1841 aa  1664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  48.01 
 
 		 1778 aa  1027    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  38 
 
 		 1580 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  38 
 
 		 1580 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  37.58 
 
 		 1823 aa  629  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  38.08 
 
 		 1577 aa  628  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 		 1580 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 		 1805 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 		 2333 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  37.99 
 
 		 1819 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  38.82 
 
 		 1806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 		 1939 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 		 1656 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  37.28 
 
 		 1537 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  38 
 
 		 2085 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  38 
 
 		 2085 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  38 
 
 		 2085 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  36.97 
 
 		 1835 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  36.4 
 
 		 2220 aa  559  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  38.67 
 
 		 1822 aa  555  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.45 
 
 		 2136 aa  553  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  37.67 
 
 		 1827 aa  553  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 1190 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 1190 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  35.98 
 
 		 1144 aa  542  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 2232 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 		 1812 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  37.3 
 
 		 1190 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  37.7 
 
 		 1263 aa  540  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 1704 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 1704 aa  539  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  37.3 
 
 		 1704 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  36.74 
 
 		 1520 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 		 2230 aa  532  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  36.74 
 
 		 1520 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.86 
 
 		 3676 aa  530  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  35.96 
 
 		 2890 aa  523  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.15 
 
 		 6768 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.61 
 
 		 3696 aa  522  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  35.57 
 
 		 2126 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.81 
 
 		 3693 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.81 
 
 		 3693 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.77 
 
 		 3702 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  36.84 
 
 		 2188 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  33.46 
 
 		 2277 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  35.04 
 
 		 1402 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  33.56 
 
 		 3508 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  34.03 
 
 		 3158 aa  510  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  36 
 
 		 3254 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  36.31 
 
 		 2090 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  34.78 
 
 		 3408 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.22 
 
 		 7210 aa  506  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.3 
 
 		 2762 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.7 
 
 		 7279 aa  506  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 		 2545 aa  506  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  35.94 
 
 		 2111 aa  505  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  35.16 
 
 		 2020 aa  505  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  35.81 
 
 		 2108 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  36.1 
 
 		 1698 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  35.84 
 
 		 2101 aa  502  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.77 
 
 		 2880 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 2544 aa  503  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 		 2544 aa  503  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  36.7 
 
 		 1744 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 		 3679 aa  503  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  34.76 
 
 		 2053 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 3874 aa  499  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.72 
 
 		 2225 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 2486 aa  499  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  33.93 
 
 		 2486 aa  499  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  36.22 
 
 		 1832 aa  500  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  35.99 
 
 		 2108 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  34.99 
 
 		 1114 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  32.4 
 
 		 3252 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  33.66 
 
 		 3449 aa  496  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.21 
 
 		 4478 aa  497  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  35.29 
 
 		 1966 aa  496  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.65 
 
 		 1822 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.4 
 
 		 3930 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.79 
 
 		 1804 aa  493  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.79 
 
 		 1587 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  36.75 
 
 		 2545 aa  493  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  33.76 
 
 		 3494 aa  493  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.59 
 
 		 1087 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  34.2 
 
 		 4183 aa  493  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.1 
 
 		 4151 aa  492  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.86 
 
 		 3176 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.28 
 
 		 1832 aa  493  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  35.68 
 
 		 2546 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>