More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4019 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 		 2060 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 		 7279 aa  725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  100 
 
 		 5526 aa  10530    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.47 
 
 		 4151 aa  737    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  37.2 
 
 		 1602 aa  632  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  35.39 
 
 		 2367 aa  634  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.74 
 
 		 3930 aa  626  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  35.93 
 
 		 6768 aa  627  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  37.48 
 
 		 4575 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.61 
 
 		 2126 aa  584  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 5400 aa  571  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  34.55 
 
 		 4607 aa  568  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  36.25 
 
 		 1616 aa  559  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  32.4 
 
 		 2020 aa  558  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.1 
 
 		 4840 aa  545  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  32.99 
 
 		 2108 aa  537  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 7110 aa  534  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.55 
 
 		 4080 aa  532  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 1874 aa  520  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  36.29 
 
 		 3670 aa  517  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.15 
 
 		 1087 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  36.37 
 
 		 3463 aa  517  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37 
 
 		 1656 aa  514  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.21 
 
 		 1354 aa  514  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.17 
 
 		 1349 aa  513  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.44 
 
 		 7210 aa  514  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  44.36 
 
 		 2666 aa  513  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 		 1587 aa  509  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.06 
 
 		 1349 aa  508  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  41.3 
 
 		 3158 aa  507  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 3874 aa  506  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  41.9 
 
 		 1017 aa  508  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 2762 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  41.39 
 
 		 1548 aa  501  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.5 
 
 		 1939 aa  501  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  39.01 
 
 		 1402 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  41.57 
 
 		 3254 aa  496  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 2551 aa  496  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 		 1144 aa  494  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  34.95 
 
 		 2847 aa  491  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 2376 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.45 
 
 		 1559 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.04 
 
 		 3176 aa  484  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 1816 aa  484  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.68 
 
 		 1559 aa  484  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  38.7 
 
 		 2066 aa  481  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.19 
 
 		 2462 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 3092 aa  481  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 		 2333 aa  480  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.95 
 
 		 1101 aa  476  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  42.91 
 
 		 2846 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  39.74 
 
 		 1955 aa  474  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.09 
 
 		 3427 aa  470  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  36.34 
 
 		 3711 aa  467  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.15 
 
 		 2551 aa  468  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.08 
 
 		 4478 aa  467  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 		 2081 aa  464  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.78 
 
 		 1337 aa  465  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  37.94 
 
 		 3337 aa  463  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  29.96 
 
 		 2719 aa  461  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.26 
 
 		 1804 aa  461  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 		 2880 aa  461  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.97 
 
 		 2232 aa  457  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  34.49 
 
 		 1909 aa  457  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 2374 aa  453  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.68 
 
 		 3508 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.72 
 
 		 3494 aa  453  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  37.97 
 
 		 3449 aa  454  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  40.09 
 
 		 2024 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.03 
 
 		 2966 aa  454  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  33.44 
 
 		 4882 aa  451  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  35.48 
 
 		 3252 aa  451  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.83 
 
 		 2230 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 		 3676 aa  451  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.8 
 
 		 3424 aa  449  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  38.05 
 
 		 4165 aa  448  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 		 3696 aa  448  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.27 
 
 		 950 aa  447  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.63 
 
 		 3702 aa  443  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  38.68 
 
 		 1795 aa  441  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  35.78 
 
 		 1574 aa  439  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 		 3693 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 2498 aa  442  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 		 3693 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39 
 
 		 2136 aa  439  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 		 3645 aa  439  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 		 3679 aa  439  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  33.38 
 
 		 5255 aa  440  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  39.53 
 
 		 3045 aa  440  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  41.51 
 
 		 4264 aa  436  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.96 
 
 		 1867 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.89 
 
 		 2890 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 		 3130 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.59 
 
 		 6889 aa  435  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 1837 aa  435  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  41.64 
 
 		 2719 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  36.72 
 
 		 2277 aa  434  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.88 
 
 		 4111 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2782  Beta-ketoacyl synthase  47.1 
 
 		 899 aa  431  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0331764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 		 2053 aa  431  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>