More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1969 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  45.98 
 
 
1489 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2498 aa  4942    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  41.89 
 
 
2462 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  57.99 
 
 
1911 aa  904    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.91 
 
 
1087 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  49.12 
 
 
2684 aa  776    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  41.8 
 
 
2316 aa  718    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  46.54 
 
 
4186 aa  725    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  44.27 
 
 
1424 aa  1022    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.71 
 
 
2551 aa  668    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 
1656 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  46.55 
 
 
1833 aa  777    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.62 
 
 
1587 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  51.45 
 
 
1646 aa  907    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  45.85 
 
 
1486 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  49.94 
 
 
1795 aa  775    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  51.43 
 
 
1560 aa  791    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  50.28 
 
 
2604 aa  780    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.91 
 
 
4239 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  53.71 
 
 
1520 aa  840    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  43.69 
 
 
3194 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  52.73 
 
 
1574 aa  893    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  44.44 
 
 
1488 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  51.66 
 
 
3130 aa  812    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  45.95 
 
 
2710 aa  777    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  52.41 
 
 
3093 aa  843    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  36.42 
 
 
3163 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  44.94 
 
 
2176 aa  757    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  47.02 
 
 
2273 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  49.56 
 
 
3335 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  48.59 
 
 
2150 aa  795    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 
1472 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  51.98 
 
 
1582 aa  870    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  47.29 
 
 
2679 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 
2551 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  49.05 
 
 
1909 aa  845    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  52.44 
 
 
3089 aa  854    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  46.61 
 
 
1466 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  48.46 
 
 
2454 aa  715    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 
1416 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  46.26 
 
 
995 aa  818    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  47.99 
 
 
2093 aa  762    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 
1472 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  52.44 
 
 
4646 aa  848    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  47.01 
 
 
4647 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  42.81 
 
 
1612 aa  701    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  45.25 
 
 
1470 aa  705    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  50.45 
 
 
1466 aa  789    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  50.46 
 
 
3090 aa  865    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  46.88 
 
 
974 aa  710    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  51.37 
 
 
1535 aa  800    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  44.91 
 
 
2682 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  47.33 
 
 
1000 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  48.4 
 
 
1653 aa  874    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  46.91 
 
 
4265 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  42.81 
 
 
1612 aa  702    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  46.91 
 
 
4265 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  49.6 
 
 
1497 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  45.95 
 
 
1472 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  51.97 
 
 
3108 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  51.3 
 
 
1302 aa  861    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 
995 aa  812    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  44.24 
 
 
1408 aa  772    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  46.09 
 
 
6889 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.97 
 
 
1337 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 
3275 aa  627  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.6 
 
 
3133 aa  623  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
1874 aa  621  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.6 
 
 
3127 aa  623  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.43 
 
 
1559 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 
2762 aa  620  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 
1559 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.48 
 
 
1354 aa  606  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  34.75 
 
 
3173 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.12 
 
 
3696 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  52.03 
 
 
926 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  41.96 
 
 
3337 aa  600  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  43.85 
 
 
3176 aa  596  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  43.83 
 
 
2243 aa  586  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.68 
 
 
3424 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.19 
 
 
3693 aa  580  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 
2226 aa  580  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.19 
 
 
3693 aa  580  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  41.26 
 
 
1524 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.56 
 
 
3702 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.31 
 
 
1349 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  41.79 
 
 
1465 aa  573  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  41.49 
 
 
1530 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  41.47 
 
 
1528 aa  570  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  38.08 
 
 
1349 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  41.49 
 
 
1530 aa  569  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.01 
 
 
1372 aa  567  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  52.98 
 
 
3235 aa  566  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.36 
 
 
2880 aa  565  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.07 
 
 
1939 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.2 
 
 
3676 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  41.71 
 
 
2477 aa  562  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.27 
 
 
4478 aa  560  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  40.5 
 
 
4101 aa  559  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.27 
 
 
950 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>