More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2580 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.3 
 
 
6889 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  37.59 
 
 
1408 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  45.01 
 
 
1466 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  31.06 
 
 
3739 aa  859    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  39.07 
 
 
995 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  40.89 
 
 
1174 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  50.24 
 
 
2710 aa  2626    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  38.57 
 
 
2316 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  42.51 
 
 
4186 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.62 
 
 
2604 aa  694    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.69 
 
 
1795 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  40.37 
 
 
1488 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 
995 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  44.81 
 
 
3090 aa  744    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  40.11 
 
 
1153 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  45.86 
 
 
3089 aa  763    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  46.26 
 
 
1424 aa  810    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.31 
 
 
3235 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  36.52 
 
 
1786 aa  1127    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  43.95 
 
 
1646 aa  1296    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  36.94 
 
 
1093 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  39.78 
 
 
1612 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  41.8 
 
 
2454 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  32.45 
 
 
3133 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  40.44 
 
 
1153 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  45.12 
 
 
1582 aa  762    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  47.86 
 
 
3335 aa  1446    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  40.77 
 
 
1833 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  46.75 
 
 
2498 aa  735    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  39.67 
 
 
1612 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  42.51 
 
 
2273 aa  1213    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  46.21 
 
 
1574 aa  775    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  32.35 
 
 
3044 aa  1067    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  41.91 
 
 
1302 aa  767    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  33.25 
 
 
2943 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.04 
 
 
3718 aa  1114    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  41.89 
 
 
2150 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  47.23 
 
 
2682 aa  2311    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
2679 aa  5487    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  43.01 
 
 
1909 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  47.97 
 
 
1911 aa  741    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.21 
 
 
4478 aa  932    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  40.57 
 
 
1489 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  44.91 
 
 
3108 aa  712    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 
2093 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  49.18 
 
 
2684 aa  2391    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.02 
 
 
1520 aa  739    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  45.9 
 
 
4646 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  44.52 
 
 
3130 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 
1535 aa  724    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  44.56 
 
 
1560 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  32.47 
 
 
3157 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  45.37 
 
 
1653 aa  778    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  41.48 
 
 
2176 aa  1153    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  43.32 
 
 
4647 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  32.34 
 
 
3148 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  45.7 
 
 
3093 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  35.03 
 
 
3099 aa  1340    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  42.22 
 
 
1486 aa  635  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  38.41 
 
 
1472 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  38.41 
 
 
1472 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  40.32 
 
 
1470 aa  632  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 
1472 aa  632  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  34.95 
 
 
2581 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  41.36 
 
 
1466 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  36.55 
 
 
1740 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  38.74 
 
 
974 aa  620  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  38.4 
 
 
1668 aa  615  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
1416 aa  610  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.52 
 
 
4239 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  42.52 
 
 
4265 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.93 
 
 
3432 aa  610  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  42.52 
 
 
4265 aa  610  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.21 
 
 
6403 aa  603  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.31 
 
 
2033 aa  600  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39 
 
 
2462 aa  600  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  40.79 
 
 
1497 aa  592  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  33.24 
 
 
2063 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  28.01 
 
 
4354 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.75 
 
 
2551 aa  584  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.87 
 
 
3133 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35 
 
 
3308 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.26 
 
 
4747 aa  582  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.87 
 
 
3127 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.71 
 
 
8646 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  39.38 
 
 
3194 aa  580  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.66 
 
 
3498 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.84 
 
 
1087 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.61 
 
 
5953 aa  573  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  34.79 
 
 
1870 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  32.54 
 
 
4196 aa  572  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.42 
 
 
3470 aa  570  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  38.9 
 
 
2226 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.97 
 
 
2370 aa  570  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.66 
 
 
4383 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  34 
 
 
1142 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  35.61 
 
 
1129 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  34.69 
 
 
1870 aa  570  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  35.43 
 
 
4489 aa  568  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.68 
 
 
1550 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>