More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05859 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  26.32 
 
 		 7214 aa  1108    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  30.8 
 
 		 3770 aa  1250    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.830211 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  27.11 
 
 		 6919 aa  1106    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.57 
 
 		 3470 aa  1781    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  39.75 
 
 		 2628 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  40.56 
 
 		 2174 aa  1300    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  38.59 
 
 		 4317 aa  1453    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  33.56 
 
 		 2387 aa  916    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  100 
 
 		 5953 aa  11900    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  63.25 
 
 		 6889 aa  4833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.88 
 
 		 2385 aa  1253    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  40.17 
 
 		 4336 aa  1515    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  45.92 
 
 		 2151 aa  1600    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  40.87 
 
 		 3168 aa  2042    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  46.56 
 
 		 5929 aa  4732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  40.93 
 
 		 1753 aa  906    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.27 
 
 		 3432 aa  2025    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  50.5 
 
 		 4531 aa  3856    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.99 
 
 		 2385 aa  1244    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  31.04 
 
 		 2345 aa  890    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  38.81 
 
 		 2385 aa  1245    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  38.43 
 
 		 2385 aa  1239    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.09 
 
 		 3133 aa  914    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  50.39 
 
 		 3328 aa  2417    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  45.7 
 
 		 1483 aa  1147    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  35.99 
 
 		 4186 aa  1085    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  40.2 
 
 		 3021 aa  1657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  44.1 
 
 		 1370 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.42 
 
 		 4336 aa  1516    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  45.56 
 
 		 2154 aa  1585    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  40.22 
 
 		 3165 aa  2007    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  46.24 
 
 		 5926 aa  4723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  47.08 
 
 		 9498 aa  4386    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  43.05 
 
 		 5372 aa  3432    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  42.47 
 
 		 5469 aa  3707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  49.37 
 
 		 13537 aa  4761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  51.87 
 
 		 6676 aa  4932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.67 
 
 		 3629 aa  1117    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  37.59 
 
 		 2867 aa  1190    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.08 
 
 		 2791 aa  1373    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  43.13 
 
 		 1142 aa  830    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  42.37 
 
 		 3308 aa  2371    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  44.72 
 
 		 3498 aa  1738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.93 
 
 		 2033 aa  946    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  39.24 
 
 		 1786 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  37.39 
 
 		 1436 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  34.37 
 
 		 3287 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  35.93 
 
 		 1739 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  32.55 
 
 		 6274 aa  1969    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.35 
 
 		 4239 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  43.02 
 
 		 6072 aa  4046    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  47.53 
 
 		 4572 aa  3644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  47.3 
 
 		 3291 aa  2660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  42.72 
 
 		 5654 aa  896    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  44.02 
 
 		 4502 aa  1636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  39.61 
 
 		 1383 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  43.66 
 
 		 2136 aa  1582    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  41.76 
 
 		 5422 aa  3576    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  41.81 
 
 		 4882 aa  3130    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  40.91 
 
 		 3002 aa  1713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  44.67 
 
 		 1369 aa  805    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  41.12 
 
 		 4332 aa  1490    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  35.65 
 
 		 3219 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  35.94 
 
 		 1663 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.99 
 
 		 2385 aa  1244    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  36.79 
 
 		 4037 aa  1121    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  43.23 
 
 		 1138 aa  748    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.49 
 
 		 1801 aa  816    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  39.07 
 
 		 3650 aa  1415    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  34.82 
 
 		 3296 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  37.92 
 
 		 4290 aa  2023    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  40.99 
 
 		 4489 aa  2493    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  38.72 
 
 		 2605 aa  1163    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  33.01 
 
 		 3102 aa  1373    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  34.78 
 
 		 3180 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  37.3 
 
 		 1675 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  26.08 
 
 		 3137 aa  832    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.72 
 
 		 2457 aa  813    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  36.89 
 
 		 3231 aa  781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  36.34 
 
 		 1662 aa  750    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  29.89 
 
 		 2638 aa  746    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  37.56 
 
 		 3227 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  43.05 
 
 		 3176 aa  1216    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.4 
 
 		 4478 aa  844    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.32 
 
 		 2352 aa  888    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  38.85 
 
 		 4342 aa  1515    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  40.49 
 
 		 5149 aa  1413    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  43.64 
 
 		 2189 aa  1456    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  44.56 
 
 		 2448 aa  1645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  37.3 
 
 		 3524 aa  1459    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  36.89 
 
 		 3231 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  36.34 
 
 		 1662 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.95 
 
 		 2151 aa  994    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  34.55 
 
 		 2477 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  45.31 
 
 		 1130 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  37.97 
 
 		 1779 aa  787    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  45.7 
 
 		 1528 aa  1149    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  33.27 
 
 		 2199 aa  782    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.09 
 
 		 3127 aa  912    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  45.7 
 
 		 1520 aa  1147    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>