More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2088 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.18 
 
 
3470 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  40.94 
 
 
5213 aa  813    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  35.54 
 
 
2174 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.78 
 
 
4317 aa  767    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.13 
 
 
5953 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.2 
 
 
6889 aa  803    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  43.13 
 
 
1370 aa  702    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.66 
 
 
4336 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.35 
 
 
1550 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.54 
 
 
3291 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  37.65 
 
 
2151 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.57 
 
 
4960 aa  744    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  33.86 
 
 
2573 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.86 
 
 
4317 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.82 
 
 
3432 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.81 
 
 
4318 aa  778    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.83 
 
 
5596 aa  673    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  37.02 
 
 
2125 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1616  amino acid adenylation domain-containing protein  66.44 
 
 
1665 aa  1982    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0177803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  99.19 
 
 
1732 aa  3069    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.93 
 
 
5738 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  38.06 
 
 
2845 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  37.35 
 
 
1119 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  34.56 
 
 
3432 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.41 
 
 
4336 aa  840    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  41.37 
 
 
1776 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.13 
 
 
3639 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.38 
 
 
2154 aa  850    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  37.87 
 
 
8211 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.5 
 
 
5926 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.97 
 
 
9498 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.23 
 
 
7785 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.26 
 
 
13537 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.5 
 
 
6676 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.04 
 
 
2571 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  40.08 
 
 
5230 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4038  amino acid adenylation domain-containing protein  59.49 
 
 
1659 aa  1873    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.25 
 
 
3308 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.46 
 
 
3498 aa  770    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  42.11 
 
 
2626 aa  811    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.74 
 
 
4317 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  38.14 
 
 
4991 aa  833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.94 
 
 
4317 aa  777    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  99.19 
 
 
1732 aa  3069    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  100 
 
 
1739 aa  3365    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  39.46 
 
 
1114 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.25 
 
 
1556 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.38 
 
 
6072 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  37.03 
 
 
4572 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  31.27 
 
 
2581 aa  767    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  34.81 
 
 
5654 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  36.95 
 
 
4502 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  42.08 
 
 
1110 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  37.16 
 
 
4136 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  34.84 
 
 
4882 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  72.54 
 
 
1674 aa  2317    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 
3331 aa  701    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.44 
 
 
4332 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.11 
 
 
4342 aa  802    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  66.42 
 
 
1663 aa  2003    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  32.58 
 
 
1569 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  39.97 
 
 
4037 aa  820    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  39.86 
 
 
1138 aa  722    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  41.43 
 
 
1801 aa  742    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  41.07 
 
 
2878 aa  832    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  39.96 
 
 
2137 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2417  non-ribosomal peptide synthetase, putative  87.53 
 
 
1772 aa  2728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1597  amino acid adenylation domain-containing protein  67.83 
 
 
1658 aa  1967    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  34.77 
 
 
2201 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.01 
 
 
4489 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.87 
 
 
4747 aa  835    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.46 
 
 
4968 aa  746    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.39 
 
 
2370 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  71.92 
 
 
1675 aa  2324    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.89 
 
 
3086 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  66.55 
 
 
1662 aa  2024    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  99.19 
 
 
1745 aa  3063    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40.76 
 
 
1129 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1538  amino acid adenylation domain-containing protein  66.53 
 
 
1670 aa  1925    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  36.74 
 
 
2155 aa  825    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  28.99 
 
 
2193 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.9 
 
 
4342 aa  800    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.07 
 
 
5149 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  38.48 
 
 
2189 aa  927    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  38.56 
 
 
2448 aa  916    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.36 
 
 
5328 aa  833    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.52 
 
 
4960 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  66.55 
 
 
1662 aa  2024    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  99.31 
 
 
1741 aa  3066    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  33.13 
 
 
1689 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.23 
 
 
8914 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  35.44 
 
 
3942 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  42.14 
 
 
2651 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  36.04 
 
 
6661 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.59 
 
 
6176 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  99.14 
 
 
1732 aa  3065    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  40.39 
 
 
5467 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  36.23 
 
 
6081 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
3404 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  99.19 
 
 
1732 aa  3069    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>