More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3602 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  25.79 
 
 
7214 aa  927    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  29.77 
 
 
3770 aa  1062    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09226  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  30.96 
 
 
2559 aa  776    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  26.2 
 
 
6919 aa  951    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.04 
 
 
3470 aa  1625    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  38.19 
 
 
2174 aa  1174    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.42 
 
 
4317 aa  1342    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  32.6 
 
 
2387 aa  783    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  39.02 
 
 
5953 aa  2764    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.71 
 
 
6889 aa  2786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  49.22 
 
 
2385 aa  1563    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.5 
 
 
4336 aa  1362    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  41.94 
 
 
2151 aa  1467    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  33.23 
 
 
3168 aa  1197    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  36.7 
 
 
5929 aa  2419    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.1 
 
 
1753 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.24 
 
 
3432 aa  1927    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.54 
 
 
4531 aa  2130    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  43.2 
 
 
2385 aa  1599    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  43.25 
 
 
2385 aa  1612    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  48.8 
 
 
2385 aa  1568    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  37.82 
 
 
1732 aa  663    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.54 
 
 
3133 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  42.84 
 
 
1082 aa  663    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  39.37 
 
 
3328 aa  1395    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  34.99 
 
 
4186 aa  1032    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  36.88 
 
 
3021 aa  1337    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1794  amino acid adenylation  33.71 
 
 
3064 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.81 
 
 
4336 aa  1365    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  41.91 
 
 
2154 aa  1446    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.59 
 
 
2883 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  33.39 
 
 
3165 aa  1218    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  38.07 
 
 
5926 aa  2409    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.25 
 
 
9498 aa  2789    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.69 
 
 
5372 aa  2234    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  35.06 
 
 
5469 aa  1163    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.03 
 
 
13537 aa  3048    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.95 
 
 
6676 aa  3153    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  41.74 
 
 
3629 aa  1186    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.6 
 
 
2867 aa  1159    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.93 
 
 
2791 aa  1030    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  38.78 
 
 
1142 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  41.12 
 
 
3308 aa  2278    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  38.5 
 
 
3498 aa  1561    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.82 
 
 
2033 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  35.5 
 
 
3287 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  35 
 
 
6274 aa  2055    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  42.9 
 
 
1082 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.4 
 
 
4239 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  40.1 
 
 
6072 aa  2926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  38.32 
 
 
4572 aa  2233    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.34 
 
 
3291 aa  1517    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  37.17 
 
 
5654 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  37.1 
 
 
4502 aa  1366    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  42.51 
 
 
1383 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  34.17 
 
 
2136 aa  840    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.04 
 
 
5422 aa  1918    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  37.33 
 
 
4882 aa  2057    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.96 
 
 
3002 aa  1334    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  35.22 
 
 
3031 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.37 
 
 
4332 aa  1344    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  36.99 
 
 
3219 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  38.76 
 
 
1663 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  43.2 
 
 
2385 aa  1599    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  33.41 
 
 
4037 aa  872    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  32.56 
 
 
1801 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  34.87 
 
 
3650 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  36.21 
 
 
3296 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  47.82 
 
 
4290 aa  2939    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  46.78 
 
 
4489 aa  2932    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  42.11 
 
 
2605 aa  1262    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  34.92 
 
 
3102 aa  1412    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  34.7 
 
 
3180 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  37.88 
 
 
1675 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  26.11 
 
 
3137 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  29.84 
 
 
2457 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  36.83 
 
 
3231 aa  703    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  38.82 
 
 
1662 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  37.43 
 
 
1745 aa  769    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  36.4 
 
 
3227 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.62 
 
 
3176 aa  1006    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.7 
 
 
4478 aa  698    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.34 
 
 
2352 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.73 
 
 
4342 aa  1315    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.15 
 
 
5149 aa  1150    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  41.16 
 
 
2189 aa  1309    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  46.74 
 
 
2448 aa  1661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  39.61 
 
 
3524 aa  1677    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  36.83 
 
 
3231 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  38.82 
 
 
1662 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.97 
 
 
2151 aa  881    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  37.43 
 
 
1745 aa  769    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  35.54 
 
 
2477 aa  725    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  38.44 
 
 
1721 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  42.84 
 
 
1071 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  35.57 
 
 
3297 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  32.09 
 
 
2199 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.18 
 
 
3127 aa  887    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  42.84 
 
 
1082 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  39.37 
 
 
3352 aa  1395    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>