More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4084 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  52.76 
 
 		 3470 aa  1020    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  42.3 
 
 		 2628 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  44.45 
 
 		 2174 aa  826    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  44.93 
 
 		 4317 aa  845    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  48.34 
 
 		 5953 aa  912    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  46.26 
 
 		 6889 aa  825    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.75 
 
 		 2385 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  45.63 
 
 		 4336 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  44.77 
 
 		 1104 aa  793    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  38.72 
 
 		 2625 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  55.36 
 
 		 2151 aa  1100    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  40.27 
 
 		 2875 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  41.59 
 
 		 5929 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  38.68 
 
 		 1753 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  42.21 
 
 		 3432 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  43.05 
 
 		 4531 aa  743    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.04 
 
 		 2385 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  37.67 
 
 		 2385 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  37.3 
 
 		 1568 aa  729    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  38.06 
 
 		 2385 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  39.61 
 
 		 1732 aa  706    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  38.97 
 
 		 3328 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  41.49 
 
 		 3021 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  38.36 
 
 		 1370 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  44.93 
 
 		 4336 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  44.74 
 
 		 1136 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.88 
 
 		 2666 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  53.92 
 
 		 2154 aa  1069    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  40.72 
 
 		 2883 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  39.57 
 
 		 5926 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  41.24 
 
 		 9498 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  39.9 
 
 		 5372 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  40.26 
 
 		 5467 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  42.88 
 
 		 13537 aa  747    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  42.97 
 
 		 6676 aa  760    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  43.39 
 
 		 2867 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  38.26 
 
 		 2791 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  41.49 
 
 		 1142 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  45.42 
 
 		 3308 aa  857    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  44.68 
 
 		 3498 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  43.99 
 
 		 2033 aa  860    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  38.18 
 
 		 1786 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  39.62 
 
 		 1093 aa  668    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  36.46 
 
 		 1436 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  39.28 
 
 		 1739 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  47.72 
 
 		 5230 aa  893    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  40.67 
 
 		 3231 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  41.69 
 
 		 6072 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  41.78 
 
 		 4572 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  43.77 
 
 		 3291 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  56.3 
 
 		 5654 aa  1151    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  52.97 
 
 		 4502 aa  1098    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  41.63 
 
 		 1383 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  43.43 
 
 		 4882 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  44.52 
 
 		 3002 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  39.78 
 
 		 1369 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  45.45 
 
 		 4332 aa  880    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  38.94 
 
 		 1663 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.04 
 
 		 2385 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  44.52 
 
 		 4037 aa  843    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  43.98 
 
 		 1138 aa  827    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  41.02 
 
 		 1801 aa  761    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.88 
 
 		 2370 aa  762    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  45.22 
 
 		 4317 aa  850    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  50 
 
 		 3432 aa  990    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.82 
 
 		 4489 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  39.25 
 
 		 2138 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  38.62 
 
 		 1726 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  38.36 
 
 		 3102 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  39.74 
 
 		 1675 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  39.22 
 
 		 1662 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.63 
 
 		 1331 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  41.29 
 
 		 3291 aa  764    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.01 
 
 		 3176 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.73 
 
 		 4478 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  46.4 
 
 		 4342 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  50 
 
 		 5149 aa  994    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  52.39 
 
 		 2189 aa  1059    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  50.77 
 
 		 2448 aa  1022    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  39.22 
 
 		 1662 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.87 
 
 		 8646 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  50.71 
 
 		 1129 aa  1016    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  42.31 
 
 		 2651 aa  735    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  40.37 
 
 		 1130 aa  695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  39.62 
 
 		 1779 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.5 
 
 		 1732 aa  705    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  38.97 
 
 		 3352 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.61 
 
 		 1732 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  35.87 
 
 		 1833 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  39.19 
 
 		 1745 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  40.75 
 
 		 2187 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  45.35 
 
 		 5328 aa  835    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  40.93 
 
 		 6006 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  39.61 
 
 		 1741 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 		 3395 aa  641    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  43 
 
 		 6081 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  42.04 
 
 		 4468 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  43.77 
 
 		 3348 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  39.61 
 
 		 1732 aa  706    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.99 
 
 		 4383 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>