More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2338 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  29.02 
 
 		 3770 aa  664    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.67 
 
 		 3470 aa  843    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  27.88 
 
 		 6999 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  29.4 
 
 		 2174 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.32 
 
 		 4317 aa  803    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  100 
 
 		 2387 aa  4958    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.56 
 
 		 5953 aa  912    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.42 
 
 		 6889 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.31 
 
 		 2385 aa  835    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.15 
 
 		 4336 aa  853    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  32.55 
 
 		 2151 aa  880    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  28.63 
 
 		 1726 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.52 
 
 		 3291 aa  905    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  32.56 
 
 		 5929 aa  854    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.56 
 
 		 3348 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.7 
 
 		 3432 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.16 
 
 		 4531 aa  883    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.65 
 
 		 2385 aa  847    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  28.3 
 
 		 2345 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.18 
 
 		 2385 aa  836    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  29.14 
 
 		 2125 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.8 
 
 		 4968 aa  885    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.33 
 
 		 2385 aa  843    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  26.58 
 
 		 3962 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  31.12 
 
 		 3328 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  28.69 
 
 		 4186 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.35 
 
 		 3021 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  31.61 
 
 		 4468 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  31.22 
 
 		 2137 aa  778    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.96 
 
 		 4336 aa  842    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.23 
 
 		 2154 aa  869    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.61 
 
 		 5328 aa  843    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 		 4080 aa  835    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.99 
 
 		 5926 aa  857    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.64 
 
 		 9498 aa  831    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.85 
 
 		 5372 aa  859    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  29.75 
 
 		 5469 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.18 
 
 		 13537 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.97 
 
 		 6676 aa  939    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.89 
 
 		 3629 aa  743    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  33.93 
 
 		 2386 aa  844    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  29.65 
 
 		 2155 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  29 
 
 		 2201 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.71 
 
 		 3308 aa  965    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.32 
 
 		 3498 aa  919    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  30.49 
 
 		 1714 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  33.26 
 
 		 2138 aa  911    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  29.6 
 
 		 4383 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.95 
 
 		 6661 aa  735    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.21 
 
 		 2370 aa  877    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.62 
 
 		 6072 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  31.89 
 
 		 4572 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.13 
 
 		 3291 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.83 
 
 		 5596 aa  876    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.4 
 
 		 4502 aa  891    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  29.58 
 
 		 2136 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.29 
 
 		 5422 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.7 
 
 		 4882 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.81 
 
 		 3002 aa  806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  33.58 
 
 		 2894 aa  813    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 		 2410 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.82 
 
 		 4332 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 		 2386 aa  812    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  29.06 
 
 		 3331 aa  713    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.65 
 
 		 2385 aa  847    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  28.29 
 
 		 4037 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.38 
 
 		 4317 aa  808    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  53.17 
 
 		 2391 aa  2479    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.75 
 
 		 7785 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.08 
 
 		 8646 aa  776    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  29.76 
 
 		 4290 aa  735    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  29.52 
 
 		 4489 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  31.31 
 
 		 2605 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  31.55 
 
 		 3102 aa  818    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  32.09 
 
 		 3395 aa  825    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  32.48 
 
 		 2156 aa  877    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  28.43 
 
 		 5620 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  30.02 
 
 		 2457 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  29.54 
 
 		 3114 aa  780    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  31.32 
 
 		 6081 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  28.94 
 
 		 2638 aa  780    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.2 
 
 		 4342 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.14 
 
 		 3176 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  31.35 
 
 		 4991 aa  851    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  53.17 
 
 		 2391 aa  2479    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.74 
 
 		 4317 aa  814    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.23 
 
 		 4342 aa  862    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.66 
 
 		 5149 aa  793    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  30.42 
 
 		 2189 aa  811    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.35 
 
 		 2448 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  30.98 
 
 		 1922 aa  839    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 		 6404 aa  806    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.38 
 
 		 2151 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  28.09 
 
 		 6176 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  31.28 
 
 		 6006 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  28.04 
 
 		 3942 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  28.22 
 
 		 2199 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  31.32 
 
 		 3352 aa  808    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  29.68 
 
 		 5230 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  29.28 
 
 		 2439 aa  798    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>