More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4220 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  26.93 
 
 		 7214 aa  679    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.65 
 
 		 3470 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 		 2628 aa  5297    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  37.47 
 
 		 2174 aa  853    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  47.54 
 
 		 4317 aa  2151    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  39.75 
 
 		 5953 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.65 
 
 		 6889 aa  735    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  48.83 
 
 		 3231 aa  2127    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  47.99 
 
 		 4336 aa  2235    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  39.87 
 
 		 1104 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  48.06 
 
 		 2625 aa  2266    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  37.56 
 
 		 2151 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  51.85 
 
 		 2875 aa  2482    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  36.36 
 
 		 5929 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  36.45 
 
 		 4468 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.6 
 
 		 3432 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.13 
 
 		 4531 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  29.17 
 
 		 1992 aa  778    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  33.95 
 
 		 2979 aa  1094    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.07 
 
 		 2543 aa  1067    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.14 
 
 		 3044 aa  1140    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.71 
 
 		 2295 aa  955    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  48.99 
 
 		 4342 aa  2203    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.46 
 
 		 2370 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  31.38 
 
 		 3395 aa  1316    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  41.88 
 
 		 4136 aa  1720    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  39.69 
 
 		 3348 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  47.41 
 
 		 4336 aa  2207    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  40.57 
 
 		 1136 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  47.87 
 
 		 2666 aa  2251    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.76 
 
 		 2154 aa  789    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  51.99 
 
 		 2883 aa  2471    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.8 
 
 		 5926 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.83 
 
 		 9498 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  36.83 
 
 		 5372 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.7 
 
 		 13537 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.53 
 
 		 6676 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.97 
 
 		 3629 aa  992    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.59 
 
 		 2867 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  37.45 
 
 		 8915 aa  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.41 
 
 		 1142 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.11 
 
 		 3308 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  38.38 
 
 		 3498 aa  1315    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.07 
 
 		 2033 aa  1332    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  40.08 
 
 		 3290 aa  1449    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  40.23 
 
 		 3287 aa  1460    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  42.14 
 
 		 3235 aa  1653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  33.95 
 
 		 2979 aa  1100    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.03 
 
 		 6072 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  36.97 
 
 		 4572 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  39.6 
 
 		 3291 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  41.24 
 
 		 5654 aa  1733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  42.87 
 
 		 4502 aa  1824    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  43.15 
 
 		 3432 aa  1843    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  37.62 
 
 		 4882 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  33.96 
 
 		 3002 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.12 
 
 		 3294 aa  1448    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  47.77 
 
 		 4332 aa  2248    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  40.65 
 
 		 3219 aa  1453    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  43.67 
 
 		 4991 aa  1832    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.9 
 
 		 6081 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  39.82 
 
 		 4037 aa  1667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  39.64 
 
 		 1138 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  40.06 
 
 		 1801 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  34.15 
 
 		 2967 aa  1139    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  30.72 
 
 		 3650 aa  835    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  39.86 
 
 		 3296 aa  1472    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  36.59 
 
 		 4290 aa  750    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.19 
 
 		 4383 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  34.82 
 
 		 2605 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  33.36 
 
 		 4606 aa  961    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  47.69 
 
 		 4317 aa  2152    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  45.53 
 
 		 5230 aa  1890    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  39.04 
 
 		 3180 aa  1514    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.59 
 
 		 8914 aa  710    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  29.89 
 
 		 2457 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  40.84 
 
 		 3231 aa  1472    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  39.42 
 
 		 3291 aa  744    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  40.39 
 
 		 3227 aa  1447    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  40.23 
 
 		 3290 aa  1448    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.58 
 
 		 3176 aa  1053    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  34.04 
 
 		 3018 aa  1184    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.57 
 
 		 3208 aa  1182    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  48.86 
 
 		 4342 aa  2207    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  42.65 
 
 		 5149 aa  1787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  36.66 
 
 		 2189 aa  779    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.62 
 
 		 2448 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  40.84 
 
 		 3231 aa  1472    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  41.89 
 
 		 1129 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  40.15 
 
 		 5328 aa  1580    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 		 5620 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  39.77 
 
 		 2651 aa  1503    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  34.14 
 
 		 2979 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  39.4 
 
 		 5467 aa  1560    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.12 
 
 		 3297 aa  1448    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  34.67 
 
 		 2971 aa  930    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  32.56 
 
 		 2410 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  34.7 
 
 		 3962 aa  1127    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.12 
 
 		 3294 aa  1448    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  34.46 
 
 		 6404 aa  1414    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>