More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4518 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  39.85 
 
 
3470 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  31.07 
 
 
2167 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34.87 
 
 
2174 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.54 
 
 
4317 aa  1122    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.93 
 
 
5953 aa  906    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.65 
 
 
6889 aa  961    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.29 
 
 
2385 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  40.09 
 
 
4336 aa  1165    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  38.66 
 
 
4342 aa  1079    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.12 
 
 
2151 aa  905    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  41.96 
 
 
2875 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.66 
 
 
5596 aa  909    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.18 
 
 
5929 aa  801    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  100 
 
 
1753 aa  3617    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37 
 
 
3432 aa  965    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  40.69 
 
 
4531 aa  889    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.87 
 
 
2385 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.99 
 
 
2385 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.6 
 
 
2385 aa  703    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  34.56 
 
 
3328 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  40.17 
 
 
1483 aa  686    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.58 
 
 
3235 aa  885    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  33.03 
 
 
3021 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  39.98 
 
 
1370 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40 
 
 
4336 aa  1160    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  31.83 
 
 
5620 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.21 
 
 
2154 aa  908    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  40.9 
 
 
2883 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  36.17 
 
 
2419 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.75 
 
 
5926 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.39 
 
 
9498 aa  777    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.2 
 
 
5372 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  39.21 
 
 
5230 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.56 
 
 
13537 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41 
 
 
6676 aa  909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.21 
 
 
2386 aa  670    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  39 
 
 
2867 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  39.87 
 
 
2791 aa  1187    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  38.54 
 
 
1142 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  45.1 
 
 
3308 aa  880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  36.32 
 
 
3498 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  38.38 
 
 
1126 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  40.19 
 
 
2033 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.37 
 
 
3231 aa  904    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  37.45 
 
 
1786 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.91 
 
 
1093 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  39.58 
 
 
2350 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.06 
 
 
8646 aa  877    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.58 
 
 
8914 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.59 
 
 
2370 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.11 
 
 
6072 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  33.3 
 
 
4572 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  39.74 
 
 
3291 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  37.86 
 
 
5654 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  34.31 
 
 
4502 aa  847    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  37 
 
 
1383 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.76 
 
 
4991 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  36.54 
 
 
5422 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  40.62 
 
 
4882 aa  860    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  33.7 
 
 
3002 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  40.3 
 
 
1369 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  39.97 
 
 
4332 aa  1131    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  33.37 
 
 
6081 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.87 
 
 
2385 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  39.07 
 
 
4037 aa  652    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  39.86 
 
 
1138 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.03 
 
 
1801 aa  1018    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.2 
 
 
3291 aa  793    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  39.27 
 
 
1129 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.29 
 
 
4317 aa  1119    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  30.89 
 
 
4290 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.66 
 
 
4489 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  42.34 
 
 
3432 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  31.2 
 
 
3102 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.75 
 
 
2138 aa  695    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  40.17 
 
 
1483 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.94 
 
 
3208 aa  798    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  36.47 
 
 
1569 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.96 
 
 
3176 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.42 
 
 
4478 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  38.43 
 
 
4342 aa  1083    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  38.48 
 
 
5149 aa  802    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.23 
 
 
2189 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.14 
 
 
2448 aa  776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  38.57 
 
 
8915 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.25 
 
 
2820 aa  869    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.41 
 
 
1816 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  33.21 
 
 
4468 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  40.07 
 
 
3348 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  39.67 
 
 
1130 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  37.9 
 
 
1779 aa  990    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  43.65 
 
 
4136 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  40.09 
 
 
1528 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.56 
 
 
6006 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  35.22 
 
 
2125 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  40.09 
 
 
1520 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  34.56 
 
 
3352 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.52 
 
 
4383 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.32 
 
 
3395 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.27 
 
 
1833 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>