More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7299 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  36.7 
 
 		 3130 aa  795    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  45.39 
 
 		 1488 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  45.38 
 
 		 995 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  45.19 
 
 		 2682 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  49.7 
 
 		 3133 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  43.45 
 
 		 2273 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 		 1466 aa  690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  32.05 
 
 		 2316 aa  699    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  45.88 
 
 		 4186 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  44.94 
 
 		 1489 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  49.06 
 
 		 1424 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  48.24 
 
 		 1646 aa  788    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  37.14 
 
 		 1582 aa  864    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  49.37 
 
 		 4239 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  43.91 
 
 		 974 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  49.37 
 
 		 4265 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  42.91 
 
 		 3194 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  37.98 
 
 		 1574 aa  920    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  48.24 
 
 		 2684 aa  741    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 		 3089 aa  872    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  47.1 
 
 		 2604 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  33.38 
 
 		 1465 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 		 1416 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  50.23 
 
 		 2498 aa  786    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  100 
 
 		 1466 aa  2960    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  38.49 
 
 		 2150 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  46.21 
 
 		 1472 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  44.52 
 
 		 2710 aa  699    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 		 3108 aa  867    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  44.92 
 
 		 1408 aa  762    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  32.34 
 
 		 1612 aa  681    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  44.42 
 
 		 2679 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  47.83 
 
 		 1909 aa  788    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  49.32 
 
 		 1302 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  38.83 
 
 		 1486 aa  847    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  38.57 
 
 		 2093 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  46.21 
 
 		 1472 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  38.4 
 
 		 1833 aa  751    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  43.77 
 
 		 1560 aa  770    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  42.92 
 
 		 1653 aa  897    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  47.29 
 
 		 2454 aa  708    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  45.8 
 
 		 1470 aa  710    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  39.18 
 
 		 3093 aa  867    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  46.32 
 
 		 3335 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  39.93 
 
 		 1535 aa  873    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 		 3090 aa  870    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  45.5 
 
 		 995 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  49.7 
 
 		 3127 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 4647 aa  730    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  32.27 
 
 		 1612 aa  679    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  46.27 
 
 		 1911 aa  815    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  41.44 
 
 		 1520 aa  906    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  49.37 
 
 		 4265 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  42.09 
 
 		 1497 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  46.32 
 
 		 1472 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  39.08 
 
 		 4646 aa  859    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.94 
 
 		 1795 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  44.58 
 
 		 2176 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  35.69 
 
 		 2226 aa  629  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 		 2243 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  45.39 
 
 		 6889 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  45.78 
 
 		 1000 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 2551 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  40.66 
 
 		 3163 aa  588  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.1 
 
 		 2762 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 		 2462 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 		 2551 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  42.71 
 
 		 3173 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.75 
 
 		 1337 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.83 
 
 		 1087 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 		 3275 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.49 
 
 		 1656 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.63 
 
 		 3099 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  51.86 
 
 		 926 aa  544  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 		 1559 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.11 
 
 		 2880 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.13 
 
 		 1587 aa  539  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.09 
 
 		 1559 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  53.47 
 
 		 3235 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  39.95 
 
 		 1528 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 1874 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  39.86 
 
 		 1530 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  42.5 
 
 		 2943 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 		 1354 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  39.86 
 
 		 1530 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 		 3176 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 		 3676 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.53 
 
 		 1101 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  38.84 
 
 		 1524 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 		 3693 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.8 
 
 		 3693 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 3702 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 		 3696 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.76 
 
 		 2792 aa  512  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.46 
 
 		 7279 aa  513  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.51 
 
 		 3424 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 5400 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.9 
 
 		 4478 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.74 
 
 		 1372 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  34.56 
 
 		 1658 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>