More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0139 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  99.8 
 
 		 1530 aa  3058    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  100 
 
 		 1530 aa  3067    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  85.6 
 
 		 1524 aa  2501    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  33.89 
 
 		 3093 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  98.95 
 
 		 1528 aa  2900    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  31.1 
 
 		 1653 aa  635  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  32.79 
 
 		 3108 aa  632  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  32.18 
 
 		 1582 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  35.71 
 
 		 1535 aa  620  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  34.41 
 
 		 1486 aa  619  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 		 3090 aa  615  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  32.78 
 
 		 4646 aa  606  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  31.41 
 
 		 3130 aa  606  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  32.71 
 
 		 4647 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 		 1424 aa  583  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  38.47 
 
 		 1909 aa  579  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  41.84 
 
 		 1911 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  39.12 
 
 		 1574 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 		 1646 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 		 2498 aa  560  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  32.32 
 
 		 1497 aa  562  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 		 3089 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  34.68 
 
 		 1795 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 		 1408 aa  543  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  40.48 
 
 		 2454 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  38.37 
 
 		 2273 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  39.66 
 
 		 1466 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  39.89 
 
 		 1466 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  38.83 
 
 		 1489 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  38.02 
 
 		 2679 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  40.07 
 
 		 4265 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  39.95 
 
 		 4265 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.95 
 
 		 4239 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  39.71 
 
 		 2604 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  38.24 
 
 		 4186 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  39.74 
 
 		 1560 aa  522  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  38.13 
 
 		 1470 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.65 
 
 		 3133 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  29.74 
 
 		 1833 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  38.12 
 
 		 1520 aa  519  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.65 
 
 		 3127 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  38.85 
 
 		 1488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 		 1302 aa  516  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 		 2150 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  37.55 
 
 		 2710 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  38.16 
 
 		 1472 aa  506  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  38.16 
 
 		 1472 aa  506  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  38.16 
 
 		 1472 aa  506  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  37.68 
 
 		 2682 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  36.66 
 
 		 1416 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.37 
 
 		 3335 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 		 2551 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  37.39 
 
 		 2684 aa  493  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  33.98 
 
 		 995 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.07 
 
 		 3194 aa  489  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 		 2093 aa  489  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  34.39 
 
 		 2176 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  33.3 
 
 		 2316 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  33.86 
 
 		 995 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  33.85 
 
 		 1612 aa  485  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  33.85 
 
 		 1612 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.6 
 
 		 6889 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.26 
 
 		 2762 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  37.25 
 
 		 974 aa  466  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 		 2462 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  36.82 
 
 		 3173 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 2551 aa  463  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.12 
 
 		 1656 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  36.9 
 
 		 2243 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 		 2226 aa  453  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.46 
 
 		 1087 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  35.25 
 
 		 3163 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.15 
 
 		 4478 aa  437  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 1874 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 		 1354 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  33.92 
 
 		 1465 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 		 3275 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  32.39 
 
 		 1587 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.44 
 
 		 1337 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.66 
 
 		 1349 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  35.3 
 
 		 2880 aa  417  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.44 
 
 		 1372 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.85 
 
 		 1101 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  35.71 
 
 		 3424 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.33 
 
 		 1349 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  34.45 
 
 		 3427 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.62 
 
 		 2792 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.27 
 
 		 950 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.76 
 
 		 3176 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.6 
 
 		 3099 aa  403  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  47.05 
 
 		 1353 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  47.05 
 
 		 1329 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 1816 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  34.93 
 
 		 3337 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  47.05 
 
 		 1329 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  46.44 
 
 		 1370 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  33.22 
 
 		 3252 aa  396  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 5154 aa  396  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 3696 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 5400 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>