More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1235 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  91.38 
 
 
1353 aa  2466    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  91.52 
 
 
1329 aa  2428    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  100 
 
 
1370 aa  2799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  91.45 
 
 
1329 aa  2426    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  51.83 
 
 
2498 aa  495  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  48.13 
 
 
1424 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  50.67 
 
 
2150 aa  493  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  49.41 
 
 
3090 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6994  Beta-ketoacyl synthase  31.36 
 
 
1276 aa  482  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  47.3 
 
 
1909 aa  482  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  47.37 
 
 
1582 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  45.36 
 
 
1302 aa  476  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  48.61 
 
 
1574 aa  473  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  49.61 
 
 
4646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  46.37 
 
 
1653 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  48.08 
 
 
2604 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  49.2 
 
 
2684 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  47.48 
 
 
2093 aa  462  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  47.24 
 
 
1646 aa  459  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  48.22 
 
 
3093 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  43.33 
 
 
1408 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  47.23 
 
 
1520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  46.44 
 
 
3235 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  45.97 
 
 
1535 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  47.75 
 
 
1560 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  41.98 
 
 
1000 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  48.13 
 
 
1911 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  46.12 
 
 
2710 aa  442  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  46.15 
 
 
3089 aa  440  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  46 
 
 
1833 aa  436  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  45.61 
 
 
4647 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  51.69 
 
 
926 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  45.7 
 
 
1489 aa  430  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  45.08 
 
 
1486 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  47.53 
 
 
3130 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  46.52 
 
 
1470 aa  427  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  44.25 
 
 
2316 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  44.95 
 
 
2682 aa  423  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  47.44 
 
 
1472 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3410  erythronolide synthase, Aspartate racemase  27.5 
 
 
1781 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0828019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  47.44 
 
 
1472 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  45.14 
 
 
2679 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  47.44 
 
 
1472 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  46.05 
 
 
1488 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  45.13 
 
 
3108 aa  416  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  43.82 
 
 
4186 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  42.8 
 
 
995 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  45.02 
 
 
3335 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  45.27 
 
 
1466 aa  416  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  42.8 
 
 
995 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  41.86 
 
 
1612 aa  412  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  41.68 
 
 
1612 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3070  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.77 
 
 
1208 aa  413  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  44.83 
 
 
974 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.34 
 
 
1795 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  39.9 
 
 
2176 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  47.26 
 
 
2454 aa  406  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  43.83 
 
 
2380 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  43.07 
 
 
3163 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  46.44 
 
 
1530 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  43.8 
 
 
3194 aa  399  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  45.7 
 
 
1530 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 
1466 aa  400  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  45.97 
 
 
1524 aa  396  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  45.51 
 
 
1528 aa  396  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  46.29 
 
 
1497 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  47.17 
 
 
3173 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  44.14 
 
 
3424 aa  393  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  41.25 
 
 
3275 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 
1416 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2366  polyketide synthase  46.09 
 
 
1560 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  42.3 
 
 
2896 aa  386  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2363  polyketide synthase  45.36 
 
 
1525 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  39.89 
 
 
2273 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  44.88 
 
 
3818 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  44.71 
 
 
2226 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  44.4 
 
 
2243 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  44.88 
 
 
4874 aa  377  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  44.88 
 
 
5021 aa  377  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  44.88 
 
 
5023 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  41.71 
 
 
2462 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.05 
 
 
1474 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  43.03 
 
 
1465 aa  370  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.51 
 
 
1087 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1237  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.06 
 
 
779 aa  365  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 
2508 aa  365  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  42.66 
 
 
5802 aa  364  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 
2103 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.38 
 
 
3133 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  45.07 
 
 
4265 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.07 
 
 
4239 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2376  Beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 
1620 aa  363  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  45.38 
 
 
4265 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.38 
 
 
3127 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.49 
 
 
1160 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  42.44 
 
 
1939 aa  359  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.39 
 
 
2551 aa  359  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  39.11 
 
 
1272 aa  357  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3035  beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 
2257 aa  357  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.744051  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  39.39 
 
 
4354 aa  356  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>