More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3410 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3410  erythronolide synthase, Aspartate racemase  100 
 
 		 1781 aa  3691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0828019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  28.73 
 
 		 4478 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  28.25 
 
 		 2508 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  27.89 
 
 		 1329 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  27.89 
 
 		 1329 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  27.89 
 
 		 1353 aa  417  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  27.35 
 
 		 1370 aa  416  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  42.8 
 
 		 4354 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  26.23 
 
 		 2006 aa  387  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 1424 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.62 
 
 		 3695 aa  380  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 		 1613 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.17 
 
 		 2462 aa  377  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  42.41 
 
 		 1272 aa  377  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  35.74 
 
 		 1909 aa  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  36.94 
 
 		 1653 aa  370  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 		 1582 aa  365  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  36.79 
 
 		 1466 aa  362  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2385  Beta-ketoacyl synthase  41.83 
 
 		 1298 aa  362  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0539638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.31 
 
 		 1656 aa  361  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  39.38 
 
 		 3739 aa  360  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 		 4646 aa  355  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  31.34 
 
 		 1000 aa  354  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  34.38 
 
 		 1520 aa  353  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2376  Beta-ketoacyl synthase  39.48 
 
 		 1620 aa  352  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  32.44 
 
 		 1535 aa  351  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  35.63 
 
 		 3424 aa  350  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 		 5854 aa  349  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.24 
 
 		 2880 aa  349  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  37.79 
 
 		 5993 aa  347  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  37.79 
 
 		 5915 aa  347  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.4 
 
 		 1087 aa  346  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  37.79 
 
 		 5822 aa  346  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  37.79 
 
 		 5778 aa  347  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  37.72 
 
 		 4212 aa  346  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 1354 aa  345  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 2551 aa  345  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 		 3676 aa  345  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  37.77 
 
 		 2501 aa  343  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  38.24 
 
 		 4869 aa  343  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  37.52 
 
 		 3811 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  34.69 
 
 		 2498 aa  342  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  32.21 
 
 		 1833 aa  341  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 2551 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.7 
 
 		 1474 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 		 3525 aa  338  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  35.99 
 
 		 995 aa  338  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.72 
 
 		 1349 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 		 1939 aa  337  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 3090 aa  337  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  36.01 
 
 		 995 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.47 
 
 		 2604 aa  336  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  33.49 
 
 		 3093 aa  337  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  28.36 
 
 		 2681 aa  336  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.8 
 
 		 1349 aa  335  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  33.44 
 
 		 1302 aa  334  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  37.88 
 
 		 1696 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 		 2762 aa  334  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 1874 aa  333  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 		 1646 aa  333  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  34.4 
 
 		 1574 aa  333  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 		 3693 aa  333  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 3702 aa  333  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.25 
 
 		 3693 aa  333  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  38.92 
 
 		 2684 aa  333  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  38.03 
 
 		 2727 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  33.38 
 
 		 1408 aa  332  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 		 2725 aa  332  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  36.99 
 
 		 4036 aa  331  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  33.23 
 
 		 1612 aa  331  9e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  33.9 
 
 		 1911 aa  331  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 		 5802 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.59 
 
 		 3099 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 		 3089 aa  330  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.16 
 
 		 3176 aa  330  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  33.23 
 
 		 1612 aa  330  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  38.14 
 
 		 3235 aa  329  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.8 
 
 		 3696 aa  328  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  38.01 
 
 		 1749 aa  328  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.86 
 
 		 1372 aa  328  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  32.83 
 
 		 3194 aa  327  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35.11 
 
 		 1795 aa  327  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  37.62 
 
 		 1619 aa  326  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 		 974 aa  325  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  36.74 
 
 		 5612 aa  325  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 		 1587 aa  325  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 		 2150 aa  324  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  38.37 
 
 		 1717 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 		 1974 aa  323  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  35.91 
 
 		 1560 aa  323  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  36.42 
 
 		 4588 aa  322  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.97 
 
 		 2333 aa  322  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 1601 aa  321  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  33.9 
 
 		 1144 aa  320  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.84 
 
 		 1337 aa  319  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  35.62 
 
 		 7157 aa  319  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  34.63 
 
 		 2273 aa  318  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  36.27 
 
 		 1262 aa  318  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  36.29 
 
 		 3780 aa  318  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  36.11 
 
 		 6876 aa  318  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>