More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1247 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.07 
 
 		 4747 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  49.78 
 
 		 1520 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.56 
 
 		 6889 aa  1094    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  49.78 
 
 		 4646 aa  811    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  48.94 
 
 		 3335 aa  2345    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  49.5 
 
 		 3089 aa  804    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  46.39 
 
 		 2682 aa  2226    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  44.03 
 
 		 1488 aa  712    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  46.23 
 
 		 2454 aa  1229    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  43.02 
 
 		 1174 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  40.72 
 
 		 2316 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  46.32 
 
 		 4186 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  48.52 
 
 		 2498 aa  783    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  48.24 
 
 		 3108 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  49.35 
 
 		 3093 aa  795    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 2684 aa  5399    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  41.57 
 
 		 1153 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.23 
 
 		 1408 aa  765    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  45.91 
 
 		 1582 aa  799    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  43.73 
 
 		 2273 aa  1278    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  37.82 
 
 		 3308 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  50.34 
 
 		 1424 aa  898    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  45.01 
 
 		 1466 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  37.61 
 
 		 1786 aa  1157    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  48.27 
 
 		 2604 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  48.09 
 
 		 1795 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  46.31 
 
 		 1646 aa  1420    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.82 
 
 		 1093 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  42.95 
 
 		 2176 aa  1263    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  34.6 
 
 		 3133 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.74 
 
 		 4239 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  41.21 
 
 		 1612 aa  696    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  32.53 
 
 		 3739 aa  934    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  48.39 
 
 		 1560 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.39 
 
 		 995 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  47.4 
 
 		 3090 aa  778    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  47.58 
 
 		 3130 aa  760    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  50.84 
 
 		 1911 aa  791    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  50.49 
 
 		 1574 aa  883    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  42.92 
 
 		 1416 aa  673    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  48.08 
 
 		 1653 aa  850    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  45.43 
 
 		 1489 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.62 
 
 		 3235 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  32.42 
 
 		 4354 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  35.61 
 
 		 2943 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.15 
 
 		 3718 aa  1152    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  46.35 
 
 		 2150 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 		 4647 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 		 1472 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  49.67 
 
 		 2679 aa  2455    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  44.35 
 
 		 1909 aa  760    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  36.78 
 
 		 2581 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.6 
 
 		 4478 aa  1627    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  44.87 
 
 		 1833 aa  778    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  44.49 
 
 		 1302 aa  810    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 		 3099 aa  1404    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  45.07 
 
 		 2093 aa  688    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  52.8 
 
 		 2710 aa  2769    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 		 1472 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  45.05 
 
 		 1486 aa  690    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  41.32 
 
 		 1612 aa  697    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  40.29 
 
 		 995 aa  744    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  43.86 
 
 		 1470 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  48.57 
 
 		 1535 aa  779    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 		 974 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  41.18 
 
 		 1153 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  34.68 
 
 		 3157 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  45.74 
 
 		 4265 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  45.11 
 
 		 1497 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  42.97 
 
 		 1472 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  48.3 
 
 		 1466 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  34.37 
 
 		 3148 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  45.74 
 
 		 4265 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  40.06 
 
 		 6403 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.29 
 
 		 3133 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.29 
 
 		 3127 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  40.18 
 
 		 2462 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  39.39 
 
 		 2551 aa  627  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  39.23 
 
 		 4991 aa  622  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.04 
 
 		 1087 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.69 
 
 		 5953 aa  620  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.18 
 
 		 1874 aa  614  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  36.09 
 
 		 2033 aa  617  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  41.53 
 
 		 3194 aa  616  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.2 
 
 		 1354 aa  615  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  37.65 
 
 		 1129 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  34.49 
 
 		 1740 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.65 
 
 		 3498 aa  607  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 2551 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.19 
 
 		 2370 aa  606  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.86 
 
 		 4960 aa  599  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  38.88 
 
 		 6661 aa  599  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.37 
 
 		 8646 aa  600  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.38 
 
 		 3432 aa  595  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.54 
 
 		 2867 aa  596  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  35.5 
 
 		 1142 aa  597  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.51 
 
 		 4960 aa  596  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  36.93 
 
 		 3291 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.92 
 
 		 4383 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 		 1556 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>