More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12949 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  43.37 
 
 
4646 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  42.81 
 
 
1560 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  45.39 
 
 
1466 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  42.96 
 
 
1424 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  37.77 
 
 
1646 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  42.86 
 
 
1486 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  100 
 
 
1488 aa  3019    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  44.91 
 
 
1574 aa  758    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  41.88 
 
 
3089 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  40.73 
 
 
974 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
1302 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  44.03 
 
 
2684 aa  700    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  42.13 
 
 
2150 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
995 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  57.9 
 
 
1472 aa  1686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  42.86 
 
 
3108 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  45.03 
 
 
1911 aa  692    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  40.64 
 
 
2679 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  42.87 
 
 
1909 aa  719    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  41.06 
 
 
1582 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  42 
 
 
2093 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  57.9 
 
 
1472 aa  1686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  41.95 
 
 
3090 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
995 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  59.46 
 
 
1470 aa  1740    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  38.99 
 
 
2682 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  42.48 
 
 
3130 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  37.75 
 
 
2710 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  44.8 
 
 
1535 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  40.84 
 
 
2273 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  44.43 
 
 
1520 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  38.86 
 
 
1653 aa  713    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  57.93 
 
 
1489 aa  1702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  44.44 
 
 
2498 aa  697    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  37.13 
 
 
1408 aa  683    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  42.43 
 
 
3093 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  57.9 
 
 
1472 aa  1686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 
4647 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.62 
 
 
1795 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1466 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  39.07 
 
 
1833 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  38.34 
 
 
2316 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  40.67 
 
 
4186 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  41.27 
 
 
2454 aa  619  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  40.34 
 
 
2604 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  42.64 
 
 
1497 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 
1416 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.27 
 
 
3335 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  36.74 
 
 
2176 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  37.5 
 
 
1612 aa  594  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  37.5 
 
 
1612 aa  595  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  39.47 
 
 
4265 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  39.57 
 
 
4265 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  39.47 
 
 
4239 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  40.37 
 
 
1465 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  37.64 
 
 
3194 aa  569  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.12 
 
 
3133 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.12 
 
 
3127 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.55 
 
 
2551 aa  555  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.77 
 
 
6889 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 
2226 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
3275 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 
2243 aa  536  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.69 
 
 
2462 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.8 
 
 
1087 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.88 
 
 
1656 aa  529  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.18 
 
 
1354 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.33 
 
 
1337 aa  526  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  35.93 
 
 
3163 aa  521  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.14 
 
 
1587 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  37.79 
 
 
1524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.28 
 
 
3176 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  38.26 
 
 
2943 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 
1939 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
2551 aa  510  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 
2762 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  39.01 
 
 
1528 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  41.32 
 
 
1000 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  36.56 
 
 
3173 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  38.85 
 
 
1530 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.57 
 
 
3676 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  38.85 
 
 
1530 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.27 
 
 
3693 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.27 
 
 
3693 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.73 
 
 
3696 aa  502  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  38.97 
 
 
3424 aa  499  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  35.37 
 
 
1017 aa  499  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.05 
 
 
3702 aa  499  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  36.16 
 
 
3337 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.93 
 
 
1372 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.55 
 
 
3679 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.07 
 
 
3645 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.18 
 
 
4478 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  32.72 
 
 
2477 aa  489  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 
926 aa  486  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.06 
 
 
950 aa  486  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.28 
 
 
3427 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
1874 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.55 
 
 
1559 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.55 
 
 
1559 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>