More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1709 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  32.21 
 
 
3470 aa  828    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.01 
 
 
1582 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.3 
 
 
4317 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.92 
 
 
5953 aa  948    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.6 
 
 
6889 aa  999    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.6 
 
 
5328 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30.81 
 
 
2193 aa  708    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  31.81 
 
 
2151 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  25.11 
 
 
2894 aa  699    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.1 
 
 
3432 aa  888    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.44 
 
 
4317 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.69 
 
 
4960 aa  747    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.87 
 
 
2370 aa  974    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  30.69 
 
 
1569 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  98.19 
 
 
3133 aa  5704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1022  putative polyketide synthase  98.98 
 
 
883 aa  1577    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160316  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.04 
 
 
2839 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  33.71 
 
 
2316 aa  823    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  39.91 
 
 
4186 aa  2776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  33.82 
 
 
2125 aa  903    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  41.66 
 
 
1833 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.28 
 
 
2154 aa  890    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 
1653 aa  762    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.49 
 
 
9498 aa  989    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  29.33 
 
 
5372 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.63 
 
 
13537 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.7 
 
 
6676 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.06 
 
 
2867 aa  803    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.31 
 
 
8646 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.82 
 
 
3308 aa  752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  44.58 
 
 
1424 aa  767    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.16 
 
 
3498 aa  774    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 
3089 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
1874 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  24.63 
 
 
4196 aa  671    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.92 
 
 
1656 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.5 
 
 
8914 aa  691    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  40.44 
 
 
1646 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  30.1 
 
 
4468 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  27.66 
 
 
6404 aa  736    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  41.01 
 
 
2604 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  98.08 
 
 
4239 aa  7844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  30.02 
 
 
6072 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  29.85 
 
 
4572 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.19 
 
 
2832 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.29 
 
 
4502 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.21 
 
 
3291 aa  713    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  42.23 
 
 
3130 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  49.6 
 
 
1466 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  49.26 
 
 
1911 aa  729    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  43.93 
 
 
3090 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  45.78 
 
 
1574 aa  727    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  36.66 
 
 
2176 aa  927    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.56 
 
 
2792 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  31.39 
 
 
4290 aa  740    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  32.48 
 
 
4489 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 
1408 aa  695    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  30.43 
 
 
2581 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  31.47 
 
 
3102 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.67 
 
 
4960 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  43.66 
 
 
3108 aa  688    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  38.32 
 
 
3235 aa  745    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.65 
 
 
4991 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  46.73 
 
 
3093 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  47 
 
 
2498 aa  682    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  29.52 
 
 
3348 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  42.86 
 
 
2679 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  47.68 
 
 
1520 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  36.9 
 
 
1909 aa  703    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.71 
 
 
4317 aa  778    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.95 
 
 
995 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  41.72 
 
 
2454 aa  870    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.34 
 
 
4968 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 
4646 aa  720    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  33.31 
 
 
2189 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.1 
 
 
2448 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  43.76 
 
 
1486 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.96 
 
 
2684 aa  680    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  33.38 
 
 
2201 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  42.49 
 
 
2710 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  46.59 
 
 
1560 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 
1550 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.34 
 
 
5596 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.76 
 
 
3086 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.22 
 
 
2571 aa  817    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  36.15 
 
 
8211 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  46.11 
 
 
1535 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  45.63 
 
 
1302 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  99.39 
 
 
3127 aa  2725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0299  ObsA  98.74 
 
 
870 aa  1549    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.04 
 
 
2839 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  100 
 
 
4265 aa  8480    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  35.98 
 
 
2835 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.3 
 
 
2462 aa  745    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  46.12 
 
 
2682 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  98.2 
 
 
4265 aa  7832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.42 
 
 
6081 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  33.95 
 
 
7785 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.54 
 
 
3335 aa  886    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.42 
 
 
6661 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>