More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7000 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  46.68 
 
 
2498 aa  739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  32.8 
 
 
3033 aa  910    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  38.43 
 
 
1497 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.85 
 
 
1582 aa  1178    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  31.01 
 
 
3281 aa  763    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  38.64 
 
 
1653 aa  942    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.87 
 
 
2316 aa  833    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  32.72 
 
 
7279 aa  906    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  39.96 
 
 
4186 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  45.78 
 
 
1424 aa  801    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
2551 aa  930    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  43.51 
 
 
1646 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 
4646 aa  3082    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  42.98 
 
 
2710 aa  715    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.71 
 
 
1795 aa  868    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  43.6 
 
 
3089 aa  2128    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 
1574 aa  1035    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
4647 aa  9245    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  34 
 
 
1416 aa  772    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 
1560 aa  859    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.77 
 
 
2762 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  43.94 
 
 
2454 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  43.35 
 
 
3093 aa  2123    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  31.67 
 
 
1612 aa  795    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  40.14 
 
 
1520 aa  927    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  42.85 
 
 
3090 aa  2112    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 
2150 aa  842    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.61 
 
 
3693 aa  1137    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  35.67 
 
 
1486 aa  736    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.3 
 
 
3099 aa  782    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  40.51 
 
 
995 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  41.96 
 
 
2679 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  43.45 
 
 
1909 aa  734    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 
1408 aa  663    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  41.96 
 
 
3335 aa  703    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  36.94 
 
 
2243 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  38.43 
 
 
2093 aa  798    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.61 
 
 
3693 aa  1137    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  40.95 
 
 
1911 aa  869    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.41 
 
 
995 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  41.37 
 
 
3130 aa  2094    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  36.26 
 
 
1466 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.46 
 
 
3676 aa  1126    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  41.14 
 
 
2273 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.27 
 
 
3696 aa  1115    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  41.55 
 
 
1470 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  43.5 
 
 
2604 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  37.19 
 
 
2226 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.83 
 
 
2684 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  39.41 
 
 
1535 aa  915    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.03 
 
 
3679 aa  1131    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  31.49 
 
 
1612 aa  794    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  38.55 
 
 
1833 aa  889    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  41.15 
 
 
1488 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  45.44 
 
 
1302 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.47 
 
 
3702 aa  1137    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  42.51 
 
 
1489 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  41 
 
 
2176 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  43.31 
 
 
3108 aa  2137    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  43.06 
 
 
2682 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  41.26 
 
 
4265 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.26 
 
 
4239 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.02 
 
 
1466 aa  636  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  41.26 
 
 
4265 aa  636  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  42.37 
 
 
1472 aa  632  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  42.37 
 
 
1472 aa  632  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  42.58 
 
 
1472 aa  634  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  30.17 
 
 
1559 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.98 
 
 
1559 aa  621  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.48 
 
 
3133 aa  617  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  41.48 
 
 
3127 aa  618  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  42.32 
 
 
974 aa  611  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 
4478 aa  604  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 
1656 aa  600  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.69 
 
 
3194 aa  597  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  32.06 
 
 
1465 aa  592  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  32.28 
 
 
1524 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43 
 
 
6889 aa  577  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  31.68 
 
 
1530 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  31.77 
 
 
1530 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  43.56 
 
 
1000 aa  564  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.57 
 
 
1087 aa  563  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.9 
 
 
2462 aa  561  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.75 
 
 
1337 aa  557  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  33.29 
 
 
3427 aa  554  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 
2880 aa  552  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.4 
 
 
2551 aa  551  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 
3176 aa  551  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  30.82 
 
 
4101 aa  545  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 
1587 aa  542  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
1874 aa  536  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.41 
 
 
2792 aa  536  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.36 
 
 
1354 aa  536  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.23 
 
 
3463 aa  536  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  35.84 
 
 
1658 aa  533  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 
1955 aa  532  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  36.61 
 
 
2835 aa  533  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.23 
 
 
3424 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  36.64 
 
 
2832 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.64 
 
 
2832 aa  530  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>