More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3761 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  43.33 
 
 		 4647 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.76 
 
 		 6889 aa  950    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  43.2 
 
 		 3089 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  46.22 
 
 		 1520 aa  708    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 		 1408 aa  657    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  44.38 
 
 		 3108 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  44.47 
 
 		 4186 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  30.17 
 
 		 3739 aa  781    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  45.19 
 
 		 1466 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  43.45 
 
 		 1486 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  43.5 
 
 		 1582 aa  688    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.48 
 
 		 2604 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  34.1 
 
 		 3099 aa  1243    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  42.12 
 
 		 2273 aa  1165    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  44.57 
 
 		 1424 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.92 
 
 		 1786 aa  994    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  43.27 
 
 		 1646 aa  1292    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  40.55 
 
 		 2176 aa  1113    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  34.22 
 
 		 3133 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  46.12 
 
 		 4239 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  42.39 
 
 		 3090 aa  698    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  44.64 
 
 		 3093 aa  675    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.63 
 
 		 2684 aa  2150    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 2682 aa  5428    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  41.79 
 
 		 1833 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  45.45 
 
 		 3335 aa  1289    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  44.78 
 
 		 1574 aa  720    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  33.27 
 
 		 3044 aa  1035    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  46.78 
 
 		 2498 aa  710    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 		 995 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  41.49 
 
 		 1302 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  46.12 
 
 		 4265 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  32.04 
 
 		 2943 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.48 
 
 		 3718 aa  1080    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  47.26 
 
 		 2679 aa  2291    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  40.07 
 
 		 1909 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  43.72 
 
 		 1653 aa  733    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.49 
 
 		 4478 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 		 4646 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  41.85 
 
 		 1488 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 		 995 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  45.11 
 
 		 3130 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  44.96 
 
 		 1560 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  45.35 
 
 		 1535 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.78 
 
 		 1795 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  45.52 
 
 		 1911 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  46.12 
 
 		 4265 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  47.65 
 
 		 2710 aa  2391    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  42.49 
 
 		 1489 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  42.15 
 
 		 2093 aa  635  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  38.7 
 
 		 2316 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 		 1470 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 		 1416 aa  623  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  39.42 
 
 		 1612 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.41 
 
 		 3133 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  45.53 
 
 		 3127 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  39.31 
 
 		 1612 aa  620  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 1472 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 1472 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 1472 aa  616  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  38.09 
 
 		 1174 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  40.88 
 
 		 2150 aa  606  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  38.28 
 
 		 974 aa  598  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  36.15 
 
 		 1153 aa  580  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  36.75 
 
 		 1153 aa  576  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  42.04 
 
 		 1497 aa  566  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  39.14 
 
 		 3194 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  31.92 
 
 		 3235 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  33.15 
 
 		 1093 aa  553  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  38.55 
 
 		 1466 aa  550  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  35.36 
 
 		 1668 aa  549  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.71 
 
 		 3173 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 2226 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 		 1465 aa  540  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  29.14 
 
 		 4354 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  41.5 
 
 		 1000 aa  530  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.78 
 
 		 4747 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.12 
 
 		 1656 aa  526  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 		 1740 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  39.19 
 
 		 2243 aa  523  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.76 
 
 		 3432 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.47 
 
 		 1874 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 2462 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.86 
 
 		 2033 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 1587 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  36.22 
 
 		 3163 aa  517  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.15 
 
 		 2551 aa  514  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.42 
 
 		 2581 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.7 
 
 		 3696 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  35.86 
 
 		 3337 aa  507  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.53 
 
 		 1337 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  34.64 
 
 		 1129 aa  500  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  37.79 
 
 		 1530 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  37.68 
 
 		 1530 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  37.72 
 
 		 1528 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  31.57 
 
 		 1087 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 		 3676 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  37.61 
 
 		 1524 aa  493  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.24 
 
 		 4991 aa  494  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 		 3702 aa  493  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>