More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2033 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  30.86 
 
 		 3639 aa  673    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1740 aa  3589    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  29.77 
 
 		 2867 aa  731    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  41.92 
 
 		 1093 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  30.56 
 
 		 2012 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  29.42 
 
 		 3099 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 		 2997 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  37.78 
 
 		 1668 aa  635  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  36.55 
 
 		 2679 aa  621  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  34.49 
 
 		 2684 aa  603  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  36.68 
 
 		 2710 aa  596  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  36.43 
 
 		 4747 aa  586  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  28.01 
 
 		 4483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  37.12 
 
 		 2581 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.36 
 
 		 3432 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.04 
 
 		 3235 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  29.62 
 
 		 3761 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  35.81 
 
 		 1129 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  33.7 
 
 		 3335 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.71 
 
 		 1786 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.26 
 
 		 3308 aa  563  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 		 3824 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  35.35 
 
 		 1174 aa  552  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  34.92 
 
 		 2063 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 		 2395 aa  549  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 		 2395 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 		 2664 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3685  amino acid adenylation domain protein  34.54 
 
 		 1193 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3739  amino acid adenylation domain protein  34.54 
 
 		 1193 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133452  normal  0.0805981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  27.11 
 
 		 1914 aa  536  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  34.11 
 
 		 1153 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.08 
 
 		 4531 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.89 
 
 		 6676 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.32 
 
 		 2033 aa  526  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  28.97 
 
 		 7785 aa  526  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 		 2682 aa  523  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.39 
 
 		 3498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 		 4478 aa  520  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.31 
 
 		 3470 aa  516  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 		 1153 aa  516  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  28.54 
 
 		 4090 aa  513  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  33.84 
 
 		 1556 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  32 
 
 		 3432 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.4 
 
 		 4991 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  34.92 
 
 		 1870 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.14 
 
 		 4502 aa  506  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  33.88 
 
 		 1550 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  34.92 
 
 		 1870 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.13 
 
 		 6889 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.93 
 
 		 7541 aa  503  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  33 
 
 		 2106 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.96 
 
 		 1839 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  33.62 
 
 		 1556 aa  500  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.37 
 
 		 8646 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  32.57 
 
 		 2137 aa  500  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.08 
 
 		 6403 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  34.34 
 
 		 1393 aa  496  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.77 
 
 		 2571 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.77 
 
 		 2571 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.85 
 
 		 5953 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.4 
 
 		 2791 aa  493  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.8 
 
 		 5149 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.88 
 
 		 4136 aa  490  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.22 
 
 		 4968 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.37 
 
 		 5213 aa  487  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.55 
 
 		 4960 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  34.04 
 
 		 4196 aa  487  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.51 
 
 		 2370 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.71 
 
 		 3176 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.54 
 
 		 6661 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  33.63 
 
 		 2883 aa  486  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  31.3 
 
 		 3337 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 		 5596 aa  482  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  32.82 
 
 		 1142 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  32.34 
 
 		 3291 aa  483  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.41 
 
 		 4960 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31 
 
 		 2156 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  32.24 
 
 		 3348 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.11 
 
 		 2156 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33 
 
 		 2151 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.78 
 
 		 3086 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  33.37 
 
 		 1481 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  33.77 
 
 		 2006 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.67 
 
 		 3086 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.05 
 
 		 4489 aa  477  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  32.96 
 
 		 1833 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  33.18 
 
 		 1578 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  30.79 
 
 		 4572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.12 
 
 		 2448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.72 
 
 		 4383 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 		 2156 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.09 
 
 		 3291 aa  470  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  33.7 
 
 		 1769 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 		 1568 aa  470  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  31.74 
 
 		 1816 aa  465  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  33.3 
 
 		 3942 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.62 
 
 		 4882 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  34.59 
 
 		 3695 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32.86 
 
 		 1776 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  34.06 
 
 		 7122 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>