More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02104 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  43.14 
 
 
2057 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  100 
 
 
1042 aa  2170    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  44.7 
 
 
2035 aa  718    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  47.01 
 
 
2200 aa  782    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  38.06 
 
 
2350 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 
2174 aa  601  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.99 
 
 
1113 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  34.39 
 
 
2230 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  33.91 
 
 
2258 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  34.41 
 
 
2310 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  34.72 
 
 
1131 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  33.72 
 
 
1193 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  32.12 
 
 
1678 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  33.69 
 
 
3293 aa  493  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 
1174 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  34.97 
 
 
1497 aa  488  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  33.19 
 
 
3875 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.82 
 
 
3252 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  33.57 
 
 
3021 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  30.65 
 
 
1487 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.89 
 
 
3002 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  29.81 
 
 
1514 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  31.02 
 
 
1157 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  33.55 
 
 
1734 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.56 
 
 
4165 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  30.53 
 
 
1157 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  30.64 
 
 
1167 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  36.63 
 
 
1457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  30.13 
 
 
1167 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  36.63 
 
 
1457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  30.13 
 
 
1167 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  35.45 
 
 
4268 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  32.89 
 
 
1835 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  31.79 
 
 
3739 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  32.21 
 
 
2896 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  30.61 
 
 
1414 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  36.28 
 
 
1457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  31.7 
 
 
1845 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  32.08 
 
 
1317 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  30.46 
 
 
1149 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  31.38 
 
 
1104 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  41.39 
 
 
1489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  36.22 
 
 
1469 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  36.56 
 
 
1463 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  41.47 
 
 
1501 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  32.24 
 
 
2619 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 
1862 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  30.78 
 
 
3194 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  29.73 
 
 
2338 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  29.87 
 
 
2336 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.51 
 
 
1436 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  35.8 
 
 
1511 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 
1152 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.07 
 
 
2345 aa  433  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.33 
 
 
1438 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  31.15 
 
 
1321 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 
1158 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  33 
 
 
1884 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  33.48 
 
 
2006 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 
1326 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  31.59 
 
 
1163 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  31.75 
 
 
1888 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  32.24 
 
 
1897 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 
1837 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  31.32 
 
 
2084 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  31.32 
 
 
2023 aa  386  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  28.79 
 
 
1084 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  31.4 
 
 
2090 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 
1889 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  31.78 
 
 
1894 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  31.63 
 
 
2706 aa  373  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  30.73 
 
 
1809 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  30.14 
 
 
1809 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  29.63 
 
 
1824 aa  360  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  35.66 
 
 
1567 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  35.66 
 
 
1567 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  30.3 
 
 
1825 aa  356  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  30.3 
 
 
1825 aa  356  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  27.47 
 
 
1837 aa  355  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  29.95 
 
 
1405 aa  354  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  31.97 
 
 
1699 aa  353  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  35.52 
 
 
1567 aa  352  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  30.3 
 
 
1825 aa  352  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  34.37 
 
 
1574 aa  350  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  38.49 
 
 
3650 aa  333  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.24 
 
 
2164 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09690  Non-ribosomal peptide synthetase, with condensation, AMP binding and thioesterase modules  31.14 
 
 
1388 aa  317  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.7 
 
 
3695 aa  310  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.51 
 
 
13537 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.63 
 
 
9498 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  27.61 
 
 
1393 aa  296  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  29.69 
 
 
8646 aa  295  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  27.42 
 
 
3308 aa  295  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.9 
 
 
1336 aa  293  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  30.24 
 
 
3374 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  25.71 
 
 
1518 aa  291  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  32.24 
 
 
2454 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.73 
 
 
4968 aa  290  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  25.35 
 
 
1518 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  31.49 
 
 
5422 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>