More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5921 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  37.98 
 
 		 4268 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.94 
 
 		 1337 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 		 4647 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  27.63 
 
 		 3780 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.99 
 
 		 3130 aa  926    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 2551 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 1874 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.36 
 
 		 1656 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.81 
 
 		 1587 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 		 1548 aa  686    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.74 
 
 		 1349 aa  695    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  35.61 
 
 		 2081 aa  662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.42 
 
 		 4165 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 		 3693 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  37.76 
 
 		 3281 aa  957    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  37.18 
 
 		 1955 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.87 
 
 		 1354 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 2985 aa  5801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  46.28 
 
 		 4478 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.08 
 
 		 1087 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.07 
 
 		 2762 aa  836    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 		 3693 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.14 
 
 		 3099 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 		 3676 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.98 
 
 		 1349 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 		 3089 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  44.77 
 
 		 3176 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.73 
 
 		 1559 aa  831    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 		 7279 aa  966    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.48 
 
 		 2880 aa  780    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 		 3702 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 		 1559 aa  831    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  41.03 
 
 		 3252 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  42.94 
 
 		 2477 aa  632  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  43.99 
 
 		 3679 aa  631  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.17 
 
 		 3696 aa  628  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.7 
 
 		 2551 aa  618  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 1520 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 1520 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.13 
 
 		 1372 aa  610  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  34.62 
 
 		 1577 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  43.89 
 
 		 3645 aa  606  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 		 2230 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.69 
 
 		 1101 aa  607  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38 
 
 		 2462 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 		 1581 aa  602  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  43.07 
 
 		 3099 aa  600  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  43.03 
 
 		 3337 aa  597  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  34.79 
 
 		 1580 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  34.79 
 
 		 1580 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  44.76 
 
 		 3254 aa  593  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  34.77 
 
 		 1580 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  34.85 
 
 		 1822 aa  592  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.73 
 
 		 3424 aa  590  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  44.8 
 
 		 4080 aa  588  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.32 
 
 		 1144 aa  586  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  41.68 
 
 		 1602 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 		 7110 aa  587  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  41.64 
 
 		 2024 aa  587  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.13 
 
 		 950 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  40.95 
 
 		 2047 aa  582  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 		 5400 aa  582  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 5154 aa  579  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.95 
 
 		 1816 aa  580  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  41.76 
 
 		 7210 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.89 
 
 		 3494 aa  572  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.26 
 
 		 1126 aa  570  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 3092 aa  570  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  41.26 
 
 		 4151 aa  568  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.8 
 
 		 2136 aa  567  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  28.91 
 
 		 7157 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40.87 
 
 		 3427 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  35.26 
 
 		 1812 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  41.75 
 
 		 1071 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  41.9 
 
 		 2374 aa  563  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 		 2232 aa  562  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  41.88 
 
 		 2376 aa  563  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.07 
 
 		 2113 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 1837 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.59 
 
 		 1402 aa  560  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.03 
 
 		 2719 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  34.94 
 
 		 4264 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 		 1909 aa  560  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.67 
 
 		 2367 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  44 
 
 		 2201 aa  556  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5925  beta-ketoacyl synthase  41.75 
 
 		 2644 aa  556  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.77 
 
 		 2126 aa  552  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  42.11 
 
 		 3670 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.84 
 
 		 2225 aa  547  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.72 
 
 		 3158 aa  546  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  41.99 
 
 		 3148 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.14 
 
 		 4882 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  35.69 
 
 		 1795 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.41 
 
 		 3033 aa  542  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.77 
 
 		 2066 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.88 
 
 		 3449 aa  540  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  42.21 
 
 		 2107 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.76 
 
 		 2890 aa  537  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  37.56 
 
 		 3045 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  39.1 
 
 		 2108 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>